[發明專利]鑒定人MTHFR基因C677T多態性的引物、試劑盒及方法無效
| 申請號: | 201210319117.7 | 申請日: | 2012-08-31 |
| 公開(公告)號: | CN102851365A | 公開(公告)日: | 2013-01-02 |
| 發明(設計)人: | 唐愛發;張小悅;蔡志明 | 申請(專利權)人: | 唐愛發;張小悅;蔡志明 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鑒定人 mthfr 基因 c677t 多態性 引物 試劑盒 方法 | ||
技術領域
本申請涉及鑒定人MTHFR基因C677T多態性的引物、試劑盒及方法。
背景技術
MTHFR基因(登錄號NM_005957)最常見突變是677C→T的突變,這個突變會影響MTHFR酶的活性。MTHFR酶是同性半胱氨酸(Hcy)代謝過程中的重要酶之一,MTHFR酶活性降低會導致Hcy濃度在體內升高。Hcy是一種血管損傷性氨基酸,其濃度升高可導致血管內皮損傷進而導致動脈粥樣硬化的發生。研究發現MTHFR基因C677T的多態性與腦血管病患者的血清Hcy及葉酸含量有確定關系。
發明內容
本申請提供一種能夠鑒定MTHFR基因C677T多態性的引物、試劑盒及方法。
本申請提供一種鑒定人MTHFR基因C677T多態性的引物,包括上游引物和下游引物,所述上游引物的序列是SEQ?ID?NO:1所示的序列和/或SEQ?ID?NO:2所示的序列,所述下游引物的序列是SEQ?ID?NO:3所示的序列。
進一步的,所述上游引物的序列是SEQ?ID?NO:1所示的序列和SEQ?ID?NO:2所示的序列。
一種鑒定人MTHFR基因C677T多態性的試劑盒,包括第一對引物和第二對引物,所述第一對引物的上游引物的序列如SEQ?ID?NO:1所示,所述第二對引物的上游引物的序列如SEQ?ID?NO:2所示,所述第一、二對引物的下游引物的序列均如SEQ?ID?NO:3所示。
一種鑒定人MTHFR基因C677T多態性的方法,使用所述的引物。
進一步的,對于序列分別如SEQ?ID?NO:1、SEQ?ID?NO:3所示的上、下游引物,其擴增產物的序列如SEQ?ID?NO:4所示;對于序列分別如SEQ?ID?NO:2、SEQ?ID?NO:3所示的上、下游引物,其擴增產物的序列如SEQ?ID?NO:5所示。
一種鑒定人MTHFR基因C677T多態性的方法,包括如下步驟:
a)獲取待測人基因組DNA;
b)分別使用第一對引物和第二對引物,以所述待測人基因組DNA為模板,進行PCR擴增反應,分別獲得第一、二擴增產物;其中,所述第一對引物的上游引物的序列如SEQ?ID?NO:1所示,所述第一對引物的下游引物的序列如SEQID?NO:3所示;所述第二對引物的上游引物的序列如SEQ?ID?NO:2所示,所述第二對引物的下游引物的序列如SEQ?ID?NO:3所示;
c)分別對所述第一、二擴增產物進行電泳,得到多態性鑒定結果。
進一步的,所述第一擴增產物的序列如SEQ?ID?NO:4所示,所述第二擴增產物的序列如SEQ?ID?NO:5所示。
本申請的有益效果是:1)通過設計特定的引物,能夠對MTHFR基因677位點是否突變進行鑒定,進而區分出是野生型、雜合型還是突變型。2)PCR擴增后直接電泳,從而簡化了鑒定步驟,使操作更加簡單,且降低了成本。
附圖說明
圖1是本發明的電泳結果圖。
具體實施方式
下面通過具體實施方式結合附圖對本發明作進一步詳細說明。
本發明通過ARMS-PCR技術來鑒定患者基因組中MTHFR基因C677T多態性,其在PCR反應后直接進行電泳即可區分出野生型(CC型)、雜合型(CT型)和突變型(TT型)。
根據MTHFR基因序列設計了兩對引物,該兩對引物均能夠用來擴增MTHFR基因677位點附近序列,該兩對引物分別定義為第一對引物和第二對引物。
第一對引物的上游引物的序列為:GAAGGTGTCTGCGGGCG(SEQ?IDNO:1),該序列是用來鑒定MTHFR基因677位點為C的序列(即677位點未突變)。
第二對引物的上游引物的序列為:AGAAGGTGTCTGCGGGCG(SEQ?IDNO:2),該序列是用來鑒定MTHFR基因677位點為T的序列(即677位點由C突變為T)。
第一、二對引物的下游引物的序列均為:TGGGAAAGATCCCGGGGACG(SEQ?ID?NO:3)。
上述各序列中,斜體標記堿基(兩個上游引物序列的最后一個堿基)為與待測模板相配對堿基;帶下劃線堿基為額外錯配堿基,目的是進一步增加鑒定的特異性。
本發明鑒定MTHFR基因C677T多態性的方法,包括如下步驟:
1)提取DNA
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