[發明專利]SPG11基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201210301974.4
• 申請日: 2012-08-22
• 公開（公告）號: CN103627710A
• 公開（公告）日: 2014-03-12
• 發明（設計）人: 張家堂;劉慧;趙威;于生元;管李萍;王俊;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍總醫院;深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/68;C12M1/34
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

1.一種分離的編碼SPG11突變體的核酸，其特征在于，與SEQ?ID?NO：1相比，所述核酸具有選自c.C6856T和c.2863delG的至少一種突變，

任選地，所述核酸為DNA。

2.一種分離的多肽，其特征在于，與SEQ?ID?NO：2相比，所述分離的多肽具有選自p.Arg2286X和p.Glu955Lysfs*7的至少一種突變，

任選地，所述多肽是由權利要求1所述的核酸編碼的。

3.一種篩選易患常染色體隱性遺傳型遺傳性痙攣性截癱的生物樣品的方法，其特征在于，包括以下步驟：

從所述生物樣品提取核酸樣本；

確定所述核酸樣本的核酸序列；

所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，具有選自c.C6856T和c.2863delG的至少一種突變是所述生物樣品易患常染色體隱性遺傳型遺傳性痙攣性截癱的指示，

任選地，所述生物樣品為選自人體血液、皮膚、毛發和肌肉的至少一種，

任選地，所述核酸樣本為全基因組DNA。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，從所述生物樣品提取核酸樣本進一步包括：

從所述生物樣品提取RNA樣本，優選所述RNA樣本為mRNA；以及

基于所述RNA樣本，通過反轉錄反應，獲得cDNA樣本，所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

5.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，確定所述核酸樣本的核酸序列進一步包括：

針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫；以及

對所述核酸測序文庫進行測序，以便獲得由多個測序數據構成的測序結果，任選地，采用選自Hiseq2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種對所述核酸測序文庫進行測序，

任選地，針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫進一步包括：

利用SPG11基因外顯子特異性引物，對所述核酸樣本進行PCR擴增；以及

針對所得到的擴增產物，構建所述核酸測序文庫，

任選地，所述SPG11基因外顯子特異性引物具有如SEQ?ID?NO：7-10所示的核苷酸序列。

6.一種篩選易患常染色體隱性遺傳型遺傳性痙攣性截癱的生物樣品的系統，其特征在于，包括：

核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；

核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；

判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，是否具有選自c.C6856T和c.2863delG的至少一種突變，判斷所述生物樣品是否易患常染色體隱性遺傳型遺傳性痙攣性截癱。

7.根據權利要求6所述的系統，其特征在于，所述核酸提取裝置進一步包括：

RNA提取單元，所述RNA提取單元用于從所述生物樣品提取RNA樣本；以及

反轉錄單元，所述反轉錄單元與所述RNA提取單元相連，用于對所述RNA樣本進行反轉錄反應，以便獲得cDNA樣本，所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

8.根據權利要求6所述的系統，其特征在于，所述核酸序列確定裝置進一步包括：

文庫構建單元，所述文庫構建單元用于針對所述核酸樣本，構建核酸測序文庫；以及

測序單元，所述測序單元與所述文庫構建單元相連，用于對所述核酸測序文庫進行測序，以便獲得由多個測序數據構成的測序結果，

任選地，所述文庫構建單元進一步包括：

PCR擴增模塊，所述PCR擴增模塊中設置有SPG11基因外顯子特異性引物，以便利用SPG11基因外顯子特異性引物，對所述核酸樣本進行PCR擴增，

任選地，所述SPG11基因外顯子特異性引物具有如SEQ?ID?NO：7-10所示的核苷酸序列，

任選地，所述測序單元包括選自Hiseq2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種。