[發(fā)明專利]一種生物芯片微陣列點陣方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210282308.0
• 申請日: 2012-08-09
• 公開（公告）號: CN102864499A
• 公開（公告）日: 2013-01-09
• 發(fā)明（設計）人: 翁長仁
• 申請（專利權(quán)）人: 龍巖九健生物芯片技術(shù)研究所
• 主分類號: C40B50/14
• 分類號: C40B50/14
• 代理公司: 廈門市首創(chuàng)君合專利事務所有限公司 35204
• 代理人: 李雁翔

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，具體地涉及一種生物芯片微陣列點陣方法。

背景技術(shù)

微陣列數(shù)據(jù)分析方法學的學術(shù)報道主要集中在生物芯片雜交后芯片數(shù)據(jù)點的常態(tài)化和系統(tǒng)誤差校正以消除不同來源的變異誤差。Yang?YH,Dudoit?S,Luu?P,Lin?DM,Peng?V,Ngai?J,Speed?TP.Normal?ization?for?cDNA?microarray?data:a?robust?composite?method?addressing?single?and?multiple?slide?systematic?variation.Nucleic?Acids?Res?2002,30(4):e15。Tarca?AL,Cooke?JE,Mackay?J.A?robust?neural?networks?approach?for?spatial?and?intensity?dependent?normalization?of?cDNA?microarray?data.Bioinformatics?2005,21:2674-2683。這主要是因為運用微陣列技術(shù)的研究多為DNA微陣列方面，而所用DNA微陣列芯片可以從生物公司購得，省去了非常煩雜的芯片制作過程。DNA芯片的制作，需要制備幾千、幾萬cDNA、PCR產(chǎn)物、或寡聚核苷酸，并要將它們點在芯片上，這一過程非常煩雜。因此，微陣列數(shù)據(jù)分析方法學的學術(shù)報道很少涉及芯片點樣陣列設計，以及如何利用特定的點陣設計避免和消除一些已知或未知來源的變異誤差。最近幾年，越來越多的學術(shù)研究課題轉(zhuǎn)向蛋白生物芯片技術(shù)，用這一技術(shù)發(fā)現(xiàn)人類疾病生物標志物用來檢測各種人類疾病。Chatterjee?M,Mohapatra?S,Ionan?A,Bawa?G,Ali-Fehmi?R,Wang?X,Nowak?J,Ye?B,Nahhas?FA,Lu?K,Witkin?SS,Fishman?D,Munkarah?A,Morris?R,Levin?NK,Shirley?NN,Tromp?G,Abrams?J,Draghici?S,Tainsky?MA.Diagnostic?markers?of?ovarian?cancer?by?high-throughput?antigen?cloning?and?detection?on?arrays.Cancer?Res.2006;66:1181-90.Chatterjee,M.Ionan,A.Draghici,S.and?Tainsky,MA.Epitomics:Global?Profiling?of?Immune?Response?to?Disease?Using?Protein?Microarrays,OMICS:A?Journal?of?Integrative?Biology,200610:499-506.Chen?C.,Wang?X,Yu,J.,et?a.Autoantibody?Profiles?Reveal?Ubiquilin1as?a?Humoral?Immune?Response?Target?in?Lung?Adenocarcinoma,2007.Cancer?Research?67,3461-3467.Draghici?S,Chatterjee?M,Tainsky?MA.Epitomics:serum?screening?for?the?early?detection?of?cancer?on?microarrays?using?complex?panels?of?tumor?antigens.Expert?Rev?Mol?Diagn.2005.5:735-43.Wang?X,Yu?J,Sreekumar?A,Varambally?S,Shen?R,Giacherio?D,Mehra?R,Montie?JE,Pienta?KJ,Sanda?MG,Kantoff?PW,Rubin?MA,Wei?JT,Ghosh?D,Chinnaiyan?AM.Autoantibody?signatures?in?prostate?cancer.N?Engl?J?Med.2005353:1224-35.Zhong?L,Hidalgo?GE,Stromberg?AJ,Khattar?NH,Jett?JR,Hirschowitz?EA.Using?protein?microarray?as?a?diagnostic?assay?for?non-small?cell?lung?cancer.Am?J?Respir?Crit?Care?Med.2005172:1308-14。與DNA芯片不同，蛋白芯片的蛋白來源比DNA更多元化，不同的研究用不同的蛋白，因此各個研究團隊需要自己制作蛋白芯片，優(yōu)化蛋白芯片點陣排列能夠降低不同來源的變異誤差，提高實驗結(jié)果的準確性。