[發明專利]一種與油菜含油量性狀緊密連鎖的分子標記及應用

有效

• 申請號: 201210280711.X
• 申請日: 2012-08-08
• 公開（公告）號: CN102766627A
• 公開（公告）日: 2012-11-07
• 發明（設計）人: 王漢中;孫美玉;華瑋;劉靜;黃順謀;王新發;劉貴華
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院油料作物研究所
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68;A01H1/04
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務所 42001
• 代理人: 王敏峰

1.一種與油菜含油量性狀緊密連鎖的分子標記，其篩選步驟是：

a)油菜品種zy036和51070進行雜交，在雜種F1代利用小孢子技術產生加倍單倍體代分離群體；

b)?采用十六烷基三甲基溴化銨法提取親本zy036和51070及DH代分離群體的葉片總DNA；

c)?搜集油菜公開數據庫的SSR并自主開發SSR、IFLP、SNP和InDel引物，對親本DNA進行??PCR擴增，產物在變性或非變性聚丙烯酰胺凝膠中電泳，染色和顯影后對條帶的大小進行判別，篩選多態性引物；

d)?利用多態性引物對DH分離群體進行分子標記基因型分析，利用Joinmap3.0軟件進行遺傳圖譜的構建，作圖參數設為重組率<0.4，LOD>1.0；利用WinQTL?Cartographer?2.5軟件進行數量性狀位點定位，LOD閾值用1000次的置換測驗確定，概率水平P＝0.05，檢測到1個位于油菜第2連鎖群?A2控制含油量的QTL，與其性狀緊密連鎖的SSR標記為BrSF34-123，該分子標記位于甘藍型油菜第2連鎖群A2的140.6cM處，其引物序列為BrSF34-123F：5’-CCCCTGCAATTTGTAACCAC-3’，BrSF34-123R：5’-CCCTTTTGAACAAGGTACGC-3’；此SSR標記在zy036的擴增片段為129個bp，其核苷酸序列為SEQ?ID?NO.3所示。

2.根據權利要求1所述的油菜含油量性狀主效基因位點的分子標記，其特征在于：所述的QTL位點位于甘藍型油菜第2連鎖群A2，對油菜含油量性狀的貢獻率為21.75%-22.91%，加性效應為1.23-2.05。

3.權利要求1所述的分子標記在油菜高含油量性狀育種中的應用。