[發明專利]一種建立核心種質研究群體的計算機模擬方法有效
| 申請號: | 201210270088.X | 申請日: | 2012-08-01 |
| 公開(公告)號: | CN102982228A | 公開(公告)日: | 2013-03-20 |
| 發明(設計)人: | 胡晉;王建成;關亞靜;徐盛春 | 申請(專利權)人: | 浙江大學 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 浙江杭州金通專利事務所有限公司 33100 | 代理人: | 王雪 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 建立 核心 種質 研究 群體 計算機 模擬 方法 | ||
1.一種建立核心種質研究群體的計算機模擬方法,包括以下步驟:
(1)田間小樣本實際數據的獲取,將8~30個種質資源樣品田間種植;考察記錄一系列田間數量性狀數據,考察的性狀為8-15個;
(2)基于田間小樣本實際數據模擬核心種質研究群體包括以下步驟:
1)計算每個性狀的均值M和標準差S;
2)將實際群體個體數根據需要擴大為N倍,得到模擬群體初步規模;
3)利用常用的構造正態分布偽隨機數方法,根據每個性狀的標準差S,在計算機中模擬出性狀數目和實際群體相同但大小為N的隨機數群體,群體中每個性狀均滿足正態分布,且均值為0,標準差為
4)將隨機化標準差群體每個個體均加上實際數據測得的對應性狀均值M,得到初步模擬群體P;
5)將該初步模擬群體P的個體隨機刪除n%,得到最終的模擬群體p。
2.如權利要求1所述的計算機模擬方法,其特征在于,在步驟(2)的2)中,所述N倍的范圍是100-2000。
3.如權利要求1所述的計算機模擬方法,其特征在于,在步驟(2)的5)中,所述n%的范圍是10%-20%。
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G06F 電數字數據處理
G06F19-00 專門適用于特定應用的數字計算或數據處理的設備或方法
G06F19-10 .生物信息學,即計算分子生物學中的遺傳或蛋白質相關的數據處理方法或系統
G06F19-12 ..用于系統生物學的建模或仿真,例如:概率模型或動態模型,遺傳基因管理網絡,蛋白質交互作用網絡或新陳代謝作用網絡
G06F19-14 ..用于發展或進化的,例如:進化的保存區域決定或進化樹結構
G06F19-16 ..用于分子結構的,例如:結構排序,結構或功能關系,蛋白質折疊,結構域拓撲,用結構數據的藥靶,涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的,例如:基因型–表型關聯,不均衡連接,種群遺傳學,結合位置鑒定,變異發生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用





