[發明專利]FOXC1基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201210262652.3
• 申請日: 2012-07-26
• 公開（公告）號: CN103571847A
• 公開（公告）日: 2014-02-12
• 發明（設計）人: 陳建歡;張銘志;管李萍;林偉濤;王麗娟;吳斌;陳浩宇;黃楚開;鄭玉倩;彭智培;王俊;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 汕頭大學·香港中文大學聯合汕頭國際眼科中心;深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C12Q1/68;C12Q1/02;C12M1/34;C07K14/47
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

技術領域

本發明涉及FOXC1基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離的編碼FOXC1突變體的核酸，分離的多肽，篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的方法，篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的系統，用于篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的試劑盒以及篩選治療或預防Axenfeld-Rieger綜合癥的藥物的方法。

背景技術

Axenfeld-Rieger綜合癥是以雙眼發育性缺陷,伴有或者不伴有全身發育異常為特點的發育性疾病,表現為雙眼發育性缺陷,繼發性青光眼,可伴有全身發育異常,多為牙骨和面骨異常,為常染色體的顯性遺傳,多有家族史,男女相同。眼部的臨床特點表現為:雙眼發病,視力減退,角膜后胚胎環,前房角異常,虹膜角膜粘連,虹膜發育異常,無瞳,瞳孔異位,多瞳等。全身異常的臨床特點主要表現為：牙齒異常如小牙、牙齒發育不全或少牙等；多余的臍周皮膚；顱面畸形如上頜骨發育不全。

到目前為止，已確定PITX2基因和FOXC1基因是與Axenfeld-Rieger綜合癥相關的基因，且其均為轉錄因子。但仍存在著相當一部分未知致病基因位點，預計在人類中可能仍然存在70多個位點與Axenfeld-Rieger綜合癥相關。

因而，目前對Axenfeld-Rieger綜合癥的研究仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的方法。

本發明是基于發明人的下列工作而完成的：發明人通過高通量外顯子組測序聯合候選基因突變驗證的方法確定了Axenfeld-Rieger綜合癥新的致病基因突變（FOXC1c.168delC）。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的編碼FOXC1突變體的核酸。根據本發明的實施例，該核酸與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.168delC突變。根據本發明的實施例，發明人確定了FOXC1的新突變體，該新突變體與Axenfeld-Rieger綜合癥的發病密切相關，從而通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易感Axenfeld-Rieger綜合癥。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，該多肽是由根據本發明實施例的編碼FOXC1突變體的核酸所編碼的，其與SEQ?ID?NO：2相比，閱讀框發生改變，即p.Pro56Argfs*22，具體地，從第56位氨基酸開始，由脯氨酸突變為精氨酸，新的讀碼框終止于第77位，即終止于從56位氨基酸開始算起的第22位氨基酸。通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易感Axenfeld-Rieger綜合癥。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該方法包括以下步驟：從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.168delC突變是所述生物樣品易感Axenfeld-Rieger綜合癥的指示。通過根據本發明實施例的篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的方法，可以有效地篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品。

根據本發明的第四方面，本發明提出了一種篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的系統。根據本發明的實施例，該系統包括：核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，是否具有c.168delC突變，判斷所述生物樣品是否易感Axenfeld-Rieger綜合癥。利用該系統，能夠有效地實施前述篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易感Axenfeld-Rieger綜合癥的生物樣品。