[發明專利]三種細菌的PCR檢測引物及其應用無效
| 申請號: | 201210255333.X | 申請日: | 2012-07-23 |
| 公開(公告)號: | CN102747162A | 公開(公告)日: | 2012-10-24 |
| 發明(設計)人: | 劉磊;張亮;郭玉蓉 | 申請(專利權)人: | 甘肅農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12Q1/10;C12N15/11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 細菌 pcr 檢測 引物 及其 應用 | ||
技術領域
本發明涉及PCR引物,具體地,涉及三種細菌的PCR檢測引物。
背景技術
多重PCR的主要用于多種病原微生物的同時檢測或鑒定和病原微生物,某些遺傳病及癌基因的分型鑒定。多種病原微生物的同時檢測或鑒定,是在同一PCR反應管中同時加上多種病原微生物的特異性引物,進行PCR擴增。可用于同時檢測多種病原體或鑒定出是那一型病原體感染,可系統組合的有:?①肝炎病毒的感染,在同一病人或同一供血者體內,有時存在多種肝炎病毒重疊感染,有時是甲乙丙型肝炎病毒重疊;有時可能是甲乙型肝炎病毒重疊;有時是乙丙型肝炎病毒重疊。②腸道致病性細菌的檢測,如傷寒,痢疾和霍亂,有時具有較相同的腸道癥狀,有時痢疾霍亂同存一病人并同時發病。③性病的檢測,如梅毒,淋病及艾滋病的診斷。④戰傷細菌及生物戰劑細菌的檢測,如破傷風桿菌,產氣莢膜桿菌,炭疽桿菌,鼠疫桿菌等偵檢。⑤需特殊培養的無芽胞厭氧菌,如脆弱類桿菌、艱難桿菌的鑒定等。
多重PCR的特點有:?①高效性,在同一PCR反應管內同時檢出多種病原微生物,或對有多個型別的目的基因進行分型,特別是用一滴血就可檢測多種病原體。②系統性,多重PCR很適宜于成組病原體的檢測,如肝炎病毒,腸道致病性細菌,性病,無芽胞厭氧菌,戰傷感染細菌及細菌戰劑的同時偵檢。③經濟簡便性,多種病原體在同一反應管內同時檢出,將大大的節省時間,節省試劑,節約經費開支,為臨床提供更多更準確的診斷信息。
在多重PCR反應體系中,引物之間的相互作用嚴重影響著多重PCR的結果,故在多重PCR建立之初需要明確引物之間存在怎樣的相互影響。除引物之間的相互影響外,引物的濃度對多重PCR的穩定性和靈敏度也有重要影響。
目前國內還未出現針對脂環酸芽孢桿菌、大腸埃希氏菌、沙門氏菌的多重PCR檢測引物及檢測方法。
發明內容
本發明要解決的技術問題是克服現有的缺陷,提供了一種針對脂環酸芽孢桿菌、大腸埃希氏菌、沙門氏菌同時進行檢測的多重PCR檢測引物,本發明建立的多重PCR檢測方法的最大優勢就是實現了“一管三檢”,不僅提高了檢測效率,還降低了檢測過程中因操作導致的誤差。
本發明提供了如下的技術方案:
三種細菌的PCR檢測引物,其中,三種細菌為脂環酸芽孢桿菌、大腸埃希氏菌、沙門氏菌,包括以下3對引物:
脂環酸芽孢桿菌的檢測引物:
上游引物SEQ?ID?NO.1:5'-AAAACGGCAAGAAAAAGCAG-3'
下游引物SEQ?ID?NO.2:5'-ACGCGTGGTTACAGTCTTGCG-3'
大腸埃希氏菌的檢測引物:
上游引物SEQ?ID?NO.3:5'-AAAACGGCAAGAAAAAGCAG-3'
下游引物SEQ?ID?NO.4:5'-ACGCGTGGTTACAGTCTTGCG-3'
沙門氏菌的檢測引物:
上游引物SEQ?ID?NO.5:5'-TACTTAACAGTGCTCGTTTAC-3'
下游引物SEQ?ID?NO.6:5'-ATAAACTTCATCGCACCGTCA-3'
三種細菌的PCR檢測引物在脂環酸芽孢桿菌、大腸埃希氏菌、沙門氏菌PCR檢測中的應用。
本發明具有以下有益效果:
本研究嘗試用多重PCR檢測脂環酸芽孢桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌和大腸埃希氏菌。由于沒有果汁中細菌多重PCR檢測方法的相關報道,故與常規方法比較后發現,本研究建立的三重PCR檢測方法有相同的靈敏度,并能實現一個反應檢測3種污染菌,大大提高了檢測效率。在人工模擬試驗中,建立的三重PCR檢測方法能夠在小于100個菌體每毫升的染菌量下擴增出特異性條帶,說明該檢測方法符合實際檢測要求。另外,當前用于果汁污染菌檢測的PCR技術由于受到不能區分病原菌的死活而在實際應用中受到限制,而本試驗對樣品先進行預增菌,再取增菌液進行檢測,檢測的是活的菌體。這雖然較直接從樣品中提取基因組進行檢測多耗費時間,但增菌過程在大大的提高了多重PCR檢測敏感性的同時,還避免了果汁中其他成分對DNA提取的影響以及DNA污染所帶來的假陽性結果。
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