[發明專利]HOXA1基因及其表達產物的應用

無效

• 申請號: 201210246001.5
• 申請日: 2012-07-16
• 公開（公告）號: CN103540653A
• 公開（公告）日: 2014-01-29
• 發明（設計）人: 鄧慶;韓澤廣;王群
• 申請（專利權）人: 上海人類基因組研究中心
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/113;A61K48/00;A61K39/395;A61K45/00;A61P35/00
• 代理公司: 上海浦一知識產權代理有限公司 31211
• 代理人: 王函

技術領域

本發明涉及一種基因的應用，特別是涉及一種HOXA1基因及其表達產物的應用。

背景技術

肝癌嚴重威脅著我國人民的生命健康。肝癌的診斷，尤其早期診斷是臨床診療和預后的關鍵。肝癌的治療在過去20年來已取得很大的進展，外科手術切除及肝臟移植屬于“根治性”治療，仍是肝癌治療的首要選擇。隨著肝癌早期診斷水平的提高及腫瘤治療生物學概念的改變，腫瘤局部非手術治療在肝癌治療中的地位日益提高。經導管動脈內化療栓塞（TACE）已成為不能切除肝癌治療的首選方法，是中晚期肝癌治療的重要手段。該方法可使90%以上的肝癌患者受益，但總體療效有待提高。此外，經皮肝穿刺瘤內無水乙醇治療（PEI）也是較常用的局部化療方法，對癌直徑<3cm的肝癌及門靜脈癌栓的治療有一定價值。但目前肝癌的化療藥物基本沿用其他腫瘤的治療藥物，針對性差，療效不佳，因此，迫切需要尋找新的作用靶點，研究和開發肝癌特異的新藥物，提高化療的特異性和有效性。近幾年來隨著對肝癌基礎研究的深入，生物治療在肝癌的綜合治療中取得了較大進展，成了繼手術、放療、化療后腫瘤治療的第四大療法，如免疫治療、基因治療，包括抗血管生成、自殺基因治療、腫瘤疫苗治療、siRNA技術等。但許多生物治療的臨床療效仍不十分滿意，且絕大多數還處在實驗研究階段，相關的關鍵理論和實驗技術仍需進一步研究和發展。

HOXA1基因在脊椎動物中，有一類同源基因編碼一組轉錄因子，則一類轉錄因子分為A，B，C，D家族，這類基因分布于四個不同的染色體上。這些蛋白的表達時間和空間隨著胚胎發育而改變。HOXA1基因位于7號染色體上的A家族的一員，編碼了一個與DNA結合的轉錄因子，從而調控基因表達，形態形成還有分化。有關HOXA1基因的研究文獻報道較少,特別是HOXA1基因與肝癌的關系研究還未見文獻報道。

發明內容

本發明要解決的技術問題之一是提供一種HOXA1基因及其表達產物在制備診斷肝癌的產品中的應用。

本發明要解決的技術問題之二是提供一種HOXA1基因及其表達產物在制備治療肝癌的藥物中的應用。

本發明要解決的技術問題之三是提供一對特異擴增HOXA1基因的引物，該引物可用于制備用實時定量PCR診斷肝癌的產品。

本發明要解決的技術問題之四是提供HOXA1基因特定編碼DNA片段的測序引物，該測序引物可用于制備用DNA測序診斷肝癌的產品。

本發明要解決的技術問題之五是提供HOXA1基因的siRNAs，該siRNAs可用于制備治療肝癌的藥物。

外顯子組測序是針對基因組中的蛋白質編碼區，靶向富集外顯子區域測序，以發現疾病相關遺傳變異的技術。該技術近年越來越多地應用于發現人類基因組低頻變異、鑒定單基因遺傳病致病基因和腫瘤等復雜疾病易感基因研究，成為人類疾病相關變異研究的重要工具。為了鑒定肝癌發病過程中所發生體細胞突變的基因，本發明采用了外顯子組測序技術分析了10例伴有肝內門靜脈癌栓的肝癌病人原位癌組織、門靜脈癌栓組織及對應的癌旁組織。通過對高通量數據進行嚴謹的分析，過濾篩選出475個可靠的點突變。為了鑒定重要的肝癌相關基因，通過針對91個被Sanger測序方法驗證具有突變的基因設計特異性siRNAs，在8株肝癌細胞株中篩選顯著影響細胞生存的候選基因。定量PCR檢測HOXA1基因在部分肝癌病人癌組織中表達上調。在脊椎動物中，有一類稱之為“homebox”基因，它們編碼轉錄因子，成簇分布于四條不同的染色體上。胚胎發育時這些蛋白的表達根據時間及空間變化而被調控。HOXA1基因編碼DNA結合轉錄因子，調節基因表達、形態發生及分化。

為了解決上述技術問題，本發明通過如下技術方案實現：

在本發明的一方面，提供了一種HOXA1基因及其表達產物在制備診斷肝癌的產品中的應用。

所述診斷肝癌的產品包括：用實時定量PCR診斷肝癌的產品、用DNA測序診斷肝癌的產品。

所述用實時定量PCR診斷肝癌的產品至少包括一對特異擴增HOXA1基因的引物。

所述用DNA測序診斷肝癌的產品包括：用于HOXA1基因特定編碼序列的測序引物。

在本發明的另一方面，提供了一種用于制備用實時定量PCR診斷肝癌的產品中的一對特異擴增HOXA1基因的引物，所述引物的上游引物序列具有如SEQ?ID?NO:9所示的序列或其互補序列，所述引物對的下游引物序列具有如SEQ?ID?NO:10所示的序列或其互補序列。