[發(fā)明專利]藍(lán)藻中熒光恢復(fù)蛋白的表達(dá)純化及其晶體結(jié)構(gòu)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210233832.9 | 申請日: | 2012-07-06 |
| 公開(公告)號: | CN103275199A | 公開(公告)日: | 2013-09-04 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 周紅剛;劉婷;楊誠;婁智勇;董輝;郭宇;王權(quán);傅晟;宋洋 | 申請(專利權(quán))人: | 天津市國際生物醫(yī)藥聯(lián)合研究院;南開大學(xué) |
| 主分類號: | C07K14/405 | 分類號: | C07K14/405;C12N15/63;C07K1/14;C12N15/70 |
| 代理公司: | 北京德恒律治知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11409 | 代理人: | 章社杲;孫征 |
| 地址: | 300457 天津市濱海新區(qū)經(jīng)濟(jì)技術(shù)*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 藍(lán)藻 熒光 恢復(fù) 蛋白 表達(dá) 純化 及其 晶體結(jié)構(gòu) | ||
1.一種藍(lán)藻中的熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體三維結(jié)構(gòu),其中所述藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)為藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的第26位到第134位的編碼基因,其中所述晶體三維結(jié)構(gòu)中的原子具有表1中所列的至少40%的原子坐標(biāo),或者藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體三維結(jié)構(gòu)中至少40%氨基酸的主鏈碳骨架的原子結(jié)構(gòu)坐標(biāo)與表1?中的坐標(biāo)的平均根方差小于或等于1.7埃。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體三維結(jié)構(gòu),其中所述藍(lán)藻為藍(lán)細(xì)胞PCC?6803。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體三維結(jié)構(gòu),其中所述的晶體具有P4(1)2(1)2的空間群,晶胞參數(shù)為約:a=b=87埃,c=226埃,α=β=γ=90°。
4.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體三維結(jié)構(gòu),其中所述藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體結(jié)構(gòu)在一個晶體學(xué)不對稱單位內(nèi)有6個蛋白分子,其中共存在兩種三維構(gòu)象,第一種構(gòu)象由5個α螺旋組成,其中α螺旋1包括第36位Gln到?第67位的氨基酸區(qū)段,α螺旋2包括第71位Ile到第91位Lys的氨基酸區(qū)段,α螺旋3包括第99位Ile到第Glu位氨基酸區(qū)段,α螺旋4包括第114位Ala到第118位Thr的氨基酸區(qū)段,α螺旋5包括第122位Ala到第133位Arg氨基酸區(qū)段。第二種構(gòu)象由4個α螺旋組成,其中α螺旋1包括第36位Gln到第82位Ser氨基酸區(qū)段,α螺旋2包括第95位Arg到第108位Glu氨基酸區(qū)段,α螺旋3包括第113位Ala到第118位Thr氨基酸區(qū)段,α螺旋4包括第122位Ala到第133位Arg氨基酸區(qū)段,其中藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的第一種構(gòu)象如圖1(A),第二種構(gòu)象如圖1(B)。
5.構(gòu)建高效表達(dá)藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的方法,對藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)全長基因進(jìn)行截短,獲得表達(dá)量大的重組載體,優(yōu)選地對氨基端進(jìn)行了10-30位的截短,更優(yōu)選地截去氨基端前26位。
6.表達(dá)和純化藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的方法,包括:
(a)構(gòu)建融合了標(biāo)簽蛋白基因的編碼藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)基因序列的載體,將重組載體轉(zhuǎn)化入原核或真核細(xì)胞,進(jìn)而表達(dá)帶有標(biāo)簽蛋白的藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP);
(b)將(a)獲得的FRP蛋白通過特異性的與所述特異標(biāo)簽識別的方法分離出所述目的蛋白,經(jīng)過Thrombin蛋白酶在4-30攝氏度酶切過夜,優(yōu)選地使用4-10攝氏度,進(jìn)一步將蛋白經(jīng)過一系列親和層析柱的方法進(jìn)行純化,通過丙烯酰胺凝膠的方法檢測蛋白質(zhì)純度,得到純度較高的FRP蛋白。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的表達(dá)純化藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的方法,其中所述標(biāo)簽蛋白選自His、GST、Flag-tag、Mys-tag、MBP-tag、特異性抗體,優(yōu)選地使用His標(biāo)簽,所述載體含有卡那霉素選擇性標(biāo)記基因;步驟(b)所述的過親和層析柱,優(yōu)選地使用Resource?Q離子交換層析(GE)和凝膠排阻層析(GE),更優(yōu)選地將通過Resource?Q離子交換層析之后的蛋白質(zhì)再一次反掛Ni-NTA親和層析柱,其中反掛Ni-NTA親和層析柱時,優(yōu)選地補(bǔ)充加入NaCl至終濃度300-500Mm。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的表達(dá)純化藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的方法,其中所述原核細(xì)胞是大腸桿菌。
9.結(jié)晶藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的方法,包括:
(a)將表達(dá)純化好的藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)蛋白濃縮至濃度約為15-30mg/mL;
(b)用氣相懸滴法或坐滴法篩選晶體生長條件;
(c)通過seeding等方法對蛋白晶體進(jìn)行優(yōu)化,獲得藍(lán)藻熒光恢復(fù)蛋白(FRP)的晶體。
10.表達(dá)和純化硒代蛋白質(zhì)FRP的方法,包括:
(a)通過將FRP中的亮氨酸突變?yōu)榧琢虬彼幔瑯?gòu)建表達(dá)硒代蛋白質(zhì)載體的方法;
(b)運(yùn)用大腸桿菌的BL21(DE3)表達(dá)硒代蛋白;
(c)將獲得的蛋白通過特異性的與所述特異標(biāo)簽識別的方法分離出所述目的蛋白,經(jīng)過Thrombin蛋白酶在4-30攝氏度酶切過夜,在將蛋白經(jīng)過Resource?Q離子交換層析(GE),反掛Ni-NTA親和層析柱,凝膠排阻層析(GE),得到純化好的FRP蛋白。
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