[發明專利]谷子糯質基因共分離的分子標記及其檢測方法

有效

• 申請號: 201210225440.8
• 申請日: 2012-07-03
• 公開（公告）號: CN102747153A
• 公開（公告）日: 2012-10-24
• 發明（設計）人: 白輝;李志勇;朱彥彬;全建章;曹偉月;董立;馬繼芳;劉磊;鄭直;董志平
• 申請（專利權）人: 董志平
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明提供了谷子Ⅳ型糯質基因的分子標記鑒定方法，屬于分子遺傳學領域，專用于谷子的Ⅳ型糯質基因型的分子鑒定。

背景技術

谷子，脫殼后稱小米，小米主要物質為淀粉，含量在75%左右，一般品種直鏈淀粉含量在12.8%以上?，糯性品種直鏈淀粉含量在1.24%?-7%之間。糯小米粒小，色淡黃或深黃，質地較硬，糯小米淀粉分子量比普通小米小20多倍，食用消化率比普通小米高20%以上，它還具有較高的粘滯性和良好的適口性，制成品有甜香味。加溫處理的糯小米淀粉具有較高的膨脹力和透明性，這些優良特征賦予糯小米寶貴的價值和廣泛的用途。

小米是一種營養豐富的食品，在國外糯小米也被評為“營養之王”而列為“保健食品”。經常食用小米對維持蛋白質、氨基酸的代謝平衡都有重要的作用。糯小米的功效主要有1.因其富含維生素B1、B12等，具有防止消化不良及口角生瘡的功效；2.具有防止泛胃、嘔吐的功效；3.還具有滋陰養血的功能，可以使產婦虛寒的體質得到調養，幫助她們恢復體力；4.糯小米具有減輕皺紋、色斑、色素沉著的功效。為此，糯小米有無限的加工開發潛力，對拉動我國特色谷子產業發展具有重要的作用。

十里香系優質糯性谷子資源，但其它農藝性狀很差。豫谷1號系獲國家發明獎的優良品種，梗性品質。由豫谷1號×（1066A不育材料×十里香）F4復合雜交選育而成的冀創1號（本課題組選育），是高產、優質糯性品種，其直鏈淀粉含量(占樣品干重)?僅1.22%，在國內谷子糯質品種中含量處于最低水平，表明其為高糯質品種。目前已經制成糯小米酒、糯小米醋、糯小米乳、粘糕等具有糯質特色的小米加工成品。?

冀創1號的選育過程歷經15年，而分子標記輔助育種技術通過對目標基因快速而精確的選擇，可以為育種提供了非常有效的工具。如果再以目標基因間的差異作為標記，可有效地避免分子標記與目標基因連鎖互換的問題，同時可以在苗期進行選擇，用PCR技術對DNA的質量要求不高，而且實用性很強，從而大大縮短了育種周期，也提高了選擇效率。為此，本研究開發了可以對糯質性狀進行基因型鑒定的共顯性分子標記，為建立谷子糯質基因鑒定的技術體系奠定了基礎，可以大大提高谷子糯質育種進程，促進谷子產業化發展。

發明內容

本發明的目的是：提供一種糯質谷子鑒別的分子標記方法，利用本研究開發的基于PCR的實用經濟型標記，可以有效地從谷子中鑒定出含Ⅳ型糯質基因的糯質谷子，用于谷子糯質資源的利用及糯質品種的選育，所述標記為waxy-TSI2/int1和waxy-int1-1F/4R。

本發明涉及一種鑒別谷子糯質基因的分子標記方法，其特征在于：

用二對特異擴增谷子糯質基因的共顯性InDel分子標記引物，分別命名為waxy-TSI2/int1和waxy-int1-1F/4R：

waxy-TSI2/int1上游引物：5’?GAAGTGGAGGATACTGATGGG?3’

waxy-TSI2/int1下游引物：5’?GGATTTGACTGCATGAAAATG?3’

waxy-int1-1F/4R上游引物：5’CCGTTTCGGTCGGTAGGAAG3’

waxy-int1-1F/4R下游引物：5’AGTGGGTTCGATGTTTGAAC3’

擴增谷子的DNA，若waxy-TSI2/int1引物組合能擴增出984?bp的擴增片段，并且waxy-int1-1F/4R引物組合不能擴增出540?bp的擴增片段，則該材料為含Ⅳ型糯質基因的糯質谷子。

本發明所提供的可鑒別糯質谷子的InDel標記，是通過以下方法獲得的：

1）從谷子種質資源中選育出優質糯谷子十里香，將其與梗質谷子品種豫谷1號配制正反交雜交組合F₁。收獲正反交F₁后再自交，構建糯質基因的F₂分離群體，F₂所結F₃種子經過碘液染色，梗質單株與糯質單株的分離比例符合3︰1，說明十里香的糯性由隱形單基因控制。