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[發(fā)明專利]一種檢測Leber病調(diào)控子的試劑盒及用途無效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201210207655.7 申請日: 2012-06-24
公開(公告)號: CN102747152A 公開(公告)日: 2012-10-24
發(fā)明(設(shè)計)人: 管敏鑫;冀延春;蔣萍萍;張娟娟;肖云 申請(專利權(quán))人: 浙江大學(xué)
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68
代理公司: 杭州求是專利事務(wù)所有限公司 33200 代理人: 張法高;趙杭麗
地址: 310058 浙江*** 國省代碼: 浙江;33
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 檢測 leber 調(diào)控 試劑盒 用途
【權(quán)利要求書】:

1.一種檢測Leber病調(diào)控子相關(guān)的線粒體DNA突變的試劑盒,由引物序列、提取樣本基因組DNA的試劑、PCR擴增反應(yīng)試劑、陽性標本對照、陰性標本對照以及使用說明書構(gòu)成;其中,提取樣本基因組DNA的試劑由細胞裂解液和主要成分是蛋白酶K的溶液Ⅰ組成;PCR擴增反應(yīng)試劑包括dNTP、10×PCR緩沖液、MgCl2、三蒸Taq水和酶;引物序列是:外前向引物F:?TGG?CTC?CTT?TAA?CCT?CTC?CA,外反向引物R:?AAG?GAT?TAT?GGA?TGC?GGT?TG;內(nèi)前向引物F:?CCT?ACC?ACT?CAC?CCT?AGC?AT,內(nèi)反向引物R:?AAT?CAG?TGC?GAG?CTT?AGC?GC;限制性內(nèi)切酶包括限制性內(nèi)切酶NlaⅢ;陽性標本對照是含有線粒體序列第4435位點發(fā)生A>G突變的酶切樣本、陰性標本對照是不含有線粒體序列第4435位點發(fā)生A>G突變的酶切樣本。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種檢測Leber病調(diào)控子相關(guān)的線粒體DNA突變的試劑盒,其特征在于,在上述試劑盒中,在PCR擴增反應(yīng)試劑中添加0.1-0.2μl二甲基亞砜。

3.權(quán)利要求1所述的一種檢測Leber病調(diào)控子相關(guān)的線粒體DNA突變的試劑盒在檢測與Leber病調(diào)控子相關(guān)的線粒體基因mtDNA?A4435G突變中的應(yīng)用。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,通過以下步驟實現(xiàn):

(1)基因組DNA的提取:運用蛋白酶K消化裂解法,從少量的血液標本、帶毛囊的毛發(fā)、口腔粘膜刮片、血濾紙片或唾液的樣本中提取基因組DNA;

(2)特異性PCR擴增:使用Primer?5.0軟件和Oligo7.0軟件根據(jù)SEQ?ID?NO:5所示的人類線粒體基因序列設(shè)計引物包含突變位點的基因片段3777-4679,外前向引物F:?TGG?CTC?CTT?TAA?CCT?CTC?CA,外反向引物R:?AAG?GAT?TAT?GGA?TGC?GGT?TG;內(nèi)前向引物F:?CCT?ACC?ACT?CAC?CCT?AGC?AT,內(nèi)反向引物R:?AAT?CAG?TGC?GAG?CTT?AGC?GC;?

(3)酶切鑒定:將上述PCR產(chǎn)物用限制性內(nèi)切酶NlaⅢ對A4435G突變位點處進行酶切;?

(4)突變檢測:瓊脂糖凝膠電泳檢測,直接根據(jù)酶切PCR產(chǎn)物產(chǎn)生的DNA片段數(shù)量及DNA片段大小,檢測mtDNA是否發(fā)生A4435G突變。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,在步驟(1)中,樣本來源于從毛細血管靜脈血標本、帶毛囊的毛發(fā)、口腔粘膜刮片、血濾紙片或唾液,根據(jù)取樣方式或被測樣本形式不同,對不同樣本進行預(yù)處理,樣本預(yù)處理方法如下:

(1)血標本或血濾紙片:取20~200μl血標本或1cm2的血濾紙片放入1.5ml?Eppendorf管,加入900μl紅細胞裂解緩沖液室溫靜置10min,充分裂解紅細胞,12000rpm離心1min,收集白細胞沉淀;所用緩沖液為20mmol/L?Tris-HCl,pH?7.6;

(2)帶毛囊的毛發(fā):用70%乙醇洗帶毛囊的毛發(fā)1?次,后再用蒸餾水沖洗毛發(fā)2次,在1.5ml?Eppendorf管中分別放入2~4?根毛發(fā),毛囊置于Eppendorf管底部,用干凈的剪刀剪去毛發(fā)高于Eppendorf管的部分;

(3)口腔粘膜刮片或唾液:收集唾液前,必須讓被收集者漱口,以除去口腔中過多的老化細胞、食物殘渣、牙膏、咖啡、煙,半小時內(nèi)不喝水、進食、吸煙,然后開始收集口腔粘膜刮片或唾液,選擇如下方法收集唾液樣本:①舌頭圍繞口腔刮取粘膜細胞,將0.1ml唾液直接吐進Eppendorf管內(nèi);②生理鹽水漱口,吐進Eppendorf管內(nèi),吸取PBS溶液至裝有通過上述任一種方法收集的唾液樣本的Eppendorf管中,反復(fù)吹打后,12000rpm離心5min,除去上清,重復(fù)該過程一次;③用棉拭子反復(fù)刮拭面頰內(nèi)壁6次,空氣中干燥,然后用滅菌過的鑷子小心撕去其外表面,放入Eppendorf管中;④將唾液吐在濾紙上,空氣中干燥后形成唾液斑,再用干凈的剪刀剪成1cm2碎紙片置于Eppendorf管中。

6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,在步驟(1)中經(jīng)過預(yù)處理后,用細胞裂解液和蛋白酶K對上述樣本進行消化裂解,再鹽析法去除蛋白等雜質(zhì),異丙醇沉淀DNA,最后用高壓滅菌水或TE緩沖液溶解后于-20℃保存?zhèn)溆谩?!-- SIPO -->

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