[發明專利]與冠心病易感性顯著關聯的易感區域chr2p24的單核苷酸多態性位點及其應用

有效

• 申請號: 201210186621.4
• 申請日: 2012-06-07
• 公開（公告）號: CN102747073A
• 公開（公告）日: 2012-10-24
• 發明（設計）人: 顧東風;黃建鳳;魯向鋒;楊學禮;王來元;陳恕鳳
• 申請（專利權）人: 中國醫學科學院阜外心血管病醫院
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 北京三高永信知識產權代理有限責任公司 11138
• 代理人: 孟阿妮

技術領域

本發明涉及與疾病易感性相關聯的單核苷酸多態性位點，特別涉及一種與冠心病易感性顯著關聯的易感區域chr2p24的單核苷酸多態性位點及其在評估冠心病易感性中的應用，屬于生物技術領域。

背景技術

動脈粥樣硬化性心腦血管病已成為世界范圍關注的主要健康問題。2004年的世界衛生組織（WHO）報告顯示，全世界每年心血管疾病以冠心病和腦卒中為主導致的死亡人數達高達1720萬，占所有死亡人數的三分之一。預計2020年這一數字將進一步增加50%，高達2500萬，心血管疾病是全球人類的“頭號殺手”。在中國進行的一項大規模前瞻性研究也顯示，心臟疾病已經成為中國人群的主要死亡原因，分列男、女性死亡原因的第2位和第1位。我國每年新發心肌梗死50萬人，隨著生活方式的改變以及動脈粥樣硬化相關的危險因素持續增加，冠心病與心肌梗死發病也還將呈持續上升趨勢。

大量的研究資料表明，冠心病是一種復雜疾病，是由多個微效基因與環境因素長期相互作用所致。因此鑒定出與冠心病相關的易感基因或致病基因，在人群中進一步篩選增加疾病風險的易感基因確定易感個體，將有助于冠心病的發病風險預測、新藥開發、診斷和個體化治療。從基礎到臨床，人們對此進行了大量的研究，并在冠心病的危險因素和冠心病發生的病理生理學方面積累了大量的知識，但是關于冠心病與心肌梗死發生的確切遺傳分子機制卻知之甚少，對于怎樣鑒定遺傳易感基因以及鑒定受試者的冠心病遺傳易感性，一直缺乏全面系統有效的識別方法。

發明內容

本發明實施例的目的是針對上述現有技術的缺陷，提供一系列與冠心病易感性顯著相關的單核苷酸多態性位點（SNP，single?nucleotide?polymorphism），并找出其中與冠心病易感性關聯最顯著的代表性位點，繼而提供將所述單核苷酸多態性位點用于評估冠心病易感性的用途。

為了實現上述目的本發明采取的技術方案是：

第一方面，提供一系列與冠心病易感性顯著相關的易感區域chr2p24的單核苷酸多態性位點（SNP）。在中國漢族人群中選取1515例冠心病患者和5019例正常人為研究對象，使用全基因組芯片（AffymetrixAxiom^TM?Genome-Wide?CHB?1?Array?Plate）芯片對全基因組范圍內SNP進行基因分型。利用芯片得到的數據，評價基因型和表型的關聯關系，從而得到可能與冠心病之間存在潛在關聯的區域是在染色體2p24上的TTC32-WDR35基因區域的下游,與冠心病易感性顯著關聯的單核苷酸多態性位點是位于該區域的一系列單核苷酸多態性位點，為：rs2123536，等位基因為T/C；rs12613704，等位基因為C/T；rs12617744，等位基因為T/A；rs16987049，等位基因為C/T；rs1377400，等位基因為C/T；rs10490753，等位基因為G/A；rs1530944，等位基因為G/C；rs896809，等位基因為C/T；rs1530945，等位基因為A/C；rs16987088，等位基因為A/G；rs6733260，等位基因為C/G。

第二方面，使用logistic回歸分析評估每個SNP位點與冠心病的關系，計算危險等位基因的相對危險度(Odds?ratio,OR)和95%的可信區間，得到這一系列SNP位點的危險等位基因分別是：rs2123536多態性位點為T，rs12613704多態性位點為T，rs12617744多態性位點為A，rs16987049多態性位點為T，rs1377400多態性位點為T，rs10490753多態性位點為G，rs1530944多態性位點為G，rs896809多態性位點為T，rs1530945多態性位點為A，rs16987088多態性位點為A，rs6733260多態性位點為G。