[發(fā)明專利]一種色譜-質(zhì)譜代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的新方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201210179102.5 | 申請(qǐng)日: | 2012-06-01 |
| 公開(公告)號(hào): | CN102788849A | 公開(公告)日: | 2012-11-21 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 亓云鵬;柴逸峰;范國(guó)榮;宋云龍;吳玉田 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國(guó)人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G01N30/02 | 分類號(hào): | G01N30/02 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 20043*** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 色譜 代謝 數(shù)據(jù) 分析 新方法 | ||
1.一種色譜-質(zhì)譜代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的方法,包含以下步驟:
(1)代謝物峰的識(shí)別
首先從研究體系(包括正常組、模型組、給藥組)的各個(gè)樣品中取出相同體積,混合后建立質(zhì)控(QC)樣品;取QC樣品的總離子流色譜(TIC)數(shù)據(jù),選取其中信噪比大于3的色譜峰(記為peak_i),采用化學(xué)計(jì)量學(xué)方法對(duì)peak_i進(jìn)行純度檢測(cè):對(duì)于純色譜峰,記錄每個(gè)色譜峰的左(記為L(zhǎng)peak_i)、右邊界(記為Rpeak_i)及峰值處(記為Apeak_i)的保留時(shí)間;對(duì)于經(jīng)純度檢驗(yàn)判定為重疊的色譜峰,采用化學(xué)計(jì)量學(xué)方法進(jìn)行解析,獲得重疊色譜峰中包含的純色譜與純質(zhì)譜信息;
(2)代謝物純質(zhì)譜庫的建立
基于QC樣品的色譜-質(zhì)譜數(shù)據(jù),對(duì)于每個(gè)色譜峰peak_i,將其在Lpeak_i和Rpak_i保留時(shí)間范圍內(nèi)的所有質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行加和、平均,以獲得可表征色譜峰peak_i對(duì)應(yīng)代謝物的質(zhì)譜信息;對(duì)于重疊色譜峰,采用化學(xué)計(jì)量學(xué)方法解析得到的純質(zhì)譜可直接作為表征重疊色譜峰所包含代謝物的質(zhì)譜信息;將上述二部分質(zhì)譜信息合并,即可得到QC樣品中所包含的代謝物的純質(zhì)譜庫(記為XMet);XMet里包含了研究體系中所有樣品的代謝物的純質(zhì)譜信息;
(3)統(tǒng)計(jì)分析模型的建立
對(duì)于研究體系中的每個(gè)樣品,將其在每個(gè)質(zhì)荷比(m/z)處記錄得到的色譜數(shù)據(jù)進(jìn)行加和,以得到其總質(zhì)譜;將所有樣品的總質(zhì)譜對(duì)齊,然后合并得到研究體系中各個(gè)樣品的總質(zhì)譜數(shù)據(jù)Xm×n,其中m為樣品數(shù),n為質(zhì)譜通道數(shù);對(duì)Xm×n進(jìn)行主成分分析(PCA)或偏最小二乘-判別分析(PLS-DA),建立統(tǒng)計(jì)分析模型,得到Xm×n的得分(T)和載荷(P)矩陣;
(4)代謝物投影分析
按照下列公式,將XMet投影至上述統(tǒng)計(jì)分析模型中的載荷矩陣P,即可得到XMet的得分矩陣TMet:
TMet=XMetP
將TMet矩陣的前二列繪圖,則圖上每個(gè)點(diǎn)表征一個(gè)代謝物,TMet圖中遠(yuǎn)離原點(diǎn)的代謝物即為差異性的代謝物;根據(jù)TMet圖上差異性代謝物的編號(hào),可檢索XMet得出相應(yīng)的質(zhì)譜信息,最后通過檢索質(zhì)譜數(shù)據(jù)庫即可對(duì)差異性代謝物進(jìn)行定性鑒別。
2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述的用于純度檢測(cè)的化學(xué)計(jì)量學(xué)方法可獨(dú)立選自直觀推導(dǎo)式演進(jìn)特征投影法、漸進(jìn)因子分析、主成分分析、導(dǎo)數(shù)法或正交投影法。
3.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述的重疊色譜峰的化學(xué)計(jì)量學(xué)解析方法可獨(dú)立選自直觀推導(dǎo)式演進(jìn)特征投影法、斷層掃描分析法、窗口因子分析法、正交投影法或多元曲線分辨法。
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