[發(fā)明專利]分層簡(jiǎn)化大規(guī)模圖數(shù)據(jù)的運(yùn)算方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201210176708.3 | 申請(qǐng)日: | 2012-05-31 |
| 公開(公告)號(hào): | CN102750460A | 公開(公告)日: | 2012-10-24 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 毛國(guó)勇;張燕紅;張永春;徐磊;彭穎 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 常州工學(xué)院 |
| 主分類號(hào): | G06F19/18 | 分類號(hào): | G06F19/18 |
| 代理公司: | 常州市江海陽光知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 32214 | 代理人: | 湯志和 |
| 地址: | 213011 江蘇*** | 國(guó)省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 分層 簡(jiǎn)化 大規(guī)模 數(shù)據(jù) 運(yùn)算 方法 | ||
1.一種分層簡(jiǎn)化大規(guī)模圖數(shù)據(jù)的運(yùn)算方法,其特征在于包含以下步驟:
①對(duì)原始圖G0進(jìn)行去除自回路和平行邊的預(yù)處理,得到第一級(jí)簡(jiǎn)化子圖G1=(V1,E1),其中V1為一級(jí)點(diǎn)的集合,E1為一級(jí)邊的集合;?并設(shè)第i級(jí)簡(jiǎn)化子圖Gi為下一級(jí)簡(jiǎn)化子圖Gi+1的母圖GOi;i為初值等于1的整數(shù);
②對(duì)所述母圖GOi進(jìn)行遍歷,并選擇其中具有最優(yōu)度的點(diǎn)作為遍歷的起點(diǎn)S?i+1,設(shè)所述下一級(jí)簡(jiǎn)化子圖Gi+1=(V?i+1,E?i+1),其中V?i+1為下一級(jí)點(diǎn)的集合,E?i+1為下一級(jí)邊的集合;?
③將所述起點(diǎn)S?i+1作為新加入點(diǎn)加入到所述下一級(jí)點(diǎn)的集合V?i+1中;
④把所述新加入點(diǎn)及其直接鄰接點(diǎn)加入到一集合VT?i+1中;
⑤遍歷所述集合VT?i+1中的各直接鄰接點(diǎn)的所有鄰接點(diǎn);若有一鄰接點(diǎn)不在所述集合VTi+1中,則將與該鄰接點(diǎn)對(duì)應(yīng)的所述直接鄰接點(diǎn)加入到所述集合V?i+1中,并連接所述步驟④中的新加入點(diǎn)與所述對(duì)應(yīng)的直接鄰接點(diǎn),以生成一邊,將所述邊加入到所述下一級(jí)邊的集合E?i+1中;
⑥從所述步驟⑤中得到的所述集合V?i+1中的下一個(gè)加入點(diǎn),重復(fù)所述步驟④、⑤,直至所述母圖GOi遍歷結(jié)束,以得到所述下一級(jí)點(diǎn)的集合V?i+1和下一級(jí)邊的集合E?i+1,構(gòu)成所述下一級(jí)簡(jiǎn)化子圖G?i+1=(V?i+1,E?i+1);
⑦設(shè)獲得的所述下一級(jí)簡(jiǎn)化子圖G?i+1為再下一級(jí)簡(jiǎn)化子圖的母圖GO(i+1),重復(fù)所述步驟②至⑥直至得到最優(yōu)簡(jiǎn)化子圖G。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的運(yùn)算方法,其特征在于:獲得所述步驟②中最優(yōu)度的點(diǎn)的方法,包括如下步驟:
先選擇度最多的點(diǎn)作為所述最優(yōu)度的點(diǎn);
若含有度最多的點(diǎn)有多個(gè),則依次比較各點(diǎn)的各級(jí)鄰接點(diǎn)的度的總和,取所述總和最小的點(diǎn)作為所述最優(yōu)度的點(diǎn)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2的所述運(yùn)算方法,其特征在于:所述步驟⑥中的所述遍歷結(jié)束是所述集合VT?i+1中的點(diǎn)與該級(jí)母圖中的點(diǎn)的集合Vi相等。
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G06F 電數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)處理
G06F19-00 專門適用于特定應(yīng)用的數(shù)字計(jì)算或數(shù)據(jù)處理的設(shè)備或方法
G06F19-10 .生物信息學(xué),即計(jì)算分子生物學(xué)中的遺傳或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)處理方法或系統(tǒng)
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G06F19-18 ..用于功能性基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)的,例如:基因型–表型關(guān)聯(lián),不均衡連接,種群遺傳學(xué),結(jié)合位置鑒定,變異發(fā)生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質(zhì)相互作用或蛋白質(zhì)核酸的相互作用
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