[發明專利]一種牛全基因組密碼對使用偏好性的檢測方法無效

申請號：	201210142809.9	申請日：	2012-05-10
公開（公告）號：	CN102693368A	公開（公告）日：	2012-09-26
發明（設計）人：	劉小林;張慧林;趙勝	申請（專利權）人：	西北農林科技大學
主分類號：	G06F19/18	分類號：	G06F19/18
代理公司：	暫無信息	代理人：	暫無信息
地址：	712100 陜***	國省代碼：	陜西;61
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摘要：
搜索關鍵詞：	種牛基因組密碼使用偏好檢測方法
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【權利要求書】：

1.一種牛基因組密碼對使用偏好性的檢測方法，其特征在于，包括以下步驟：

1）計算牛全基因組CDS序列的3721種密碼對的使用偏好性分值CPS；

2）根據不同密碼對的CPS值，首先分析牛基因組中單個CDS序列的密碼對使用偏好性CPB，某一CDS序列的CPB值為該序列中所有密碼對CPS值的算數平均值；

3）根據基因組上3721種密碼對的CPS值，針對基因組中的每一個CDS序列，按照CDS序列上密碼對的排列順序，構建了一個密碼對偏好性分布型；針對該生物基因組中的所有CDS序列的密碼對偏好性分布型分別從序列的5’和3’末端聯配，并計算聯配結果中的每一個密碼對位點上CPS值的平均值，得到了該生物所有CDS序列的全基因組平均密碼對偏好性分布型。

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