[發明專利]基因突變檢測用探針無效
| 申請號: | 201210132171.0 | 申請日: | 2012-04-27 |
| 公開(公告)號: | CN102766683A | 公開(公告)日: | 2012-11-07 |
| 發明(設計)人: | 平井光春;黑瀬熏;井口亞希 | 申請(專利權)人: | 愛科來株式會社 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京東方億思知識產權代理有限責任公司 11258 | 代理人: | 肖善強 |
| 地址: | 日本*** | 國省代碼: | 日本;JP |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基因突變 檢測 探針 | ||
1.一種基因突變檢測用探針,用于檢測對含有目標基因突變和非目標基因突變的對象基因進行編碼的堿基序列中的所述目標基因突變,所述探針包括從下述P1、P1-1、P1’及P1’-1的組中選擇的至少一種寡核苷酸:
(P1)寡核苷酸,其在對應于所述目標基因突變的堿基位置處具有與所述目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任意一者互補的堿基,并且在對應于所述非目標基因突變的堿基位置處具有與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基,而且其相對于與編碼所述對象基因的堿基序列的全部或部分互補的堿基序列具有至少80%以上的同一性;
(P1-1)寡核苷酸,其在對應于所述目標基因突變的堿基位置處具有與所述目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任意一者互補的堿基,并且在對應于所述非目標基因突變的堿基位置處具有與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基,而且其與和編碼所述對象基因的堿基序列具有相同堿基序列的寡核苷酸在嚴謹條件下雜交;
(P1’)寡核苷酸,其在對應于所述目標基因突變的堿基位置處具有與所述目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任意一者相同的堿基,并且在對應于所述非目標基因突變的堿基位置處具有與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基,而且其相對于與編碼所述對象基因的堿基序列的全部或部分具有至少80%以上的同一性;以及
(P1’-1)寡核苷酸,其在對應于所述目標基因突變的堿基位置處具有與所述目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任意一者相同的堿基,并且在對應于所述非目標基因突變的堿基位置處具有與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基,而且其與具有與編碼所述對象基因的堿基序列互補的堿基序列的寡核苷酸在嚴謹條件下雜交。
2.根據權利要求1所述的基因突變檢測用探針,其中,所述基因突變檢測用探針滿足下述(a)至(f)中的任一條件:
(a)在所述非目標基因突變的堿基位置的野生型堿基為A和T中的一者,并且所述非目標基因突變的突變型堿基為A和T中的另一者的情況下,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基或者與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基為C或G;
(b)在所述非目標基因突變的堿基位置的野生型堿基為C和G中的一者,并且所述非目標基因突變的突變型堿基為C和G中的另一者的情況下,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基或者與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基為A或T;
(c)在所述非目標基因突變的堿基位置的野生型堿基為A和C中的一者,并且所述非目標基因突變的突變型堿基為A和C中的另一者的情況下,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基或者與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基為T或G;
(d)在所述非目標基因突變的堿基位置的野生型堿基為從A和G中的一者,并且所述非目標基因突變的突變型堿基為A和G中的另一者的情況下,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基或者與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基為T或C;
(e)在所述非目標基因突變的堿基位置的野生型堿基為T和C中的一者,并且所述非目標基因突變的突變型堿基為T和C中的另一者的情況下,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基所述非互補的堿基為T或C,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基為A或G;
(f)在所述非目標基因突變的堿基位置的野生型堿基為T和G中的一者,并且所述非目標基因突變的突變型堿基為T和G中的另一者的情況下,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均非互補的堿基為T或G,與所述非目標基因突變的野生型堿基和突變型堿基中任何一者均不同的堿基為A或C。
3.根據權利要求1所述的基因突變檢測用探針,其中,所述寡核苷酸為熒光標記寡核苷酸。
4.根據權利要求3所述的基因突變檢測用探針,其中,所述熒光標記寡核苷酸的3’末端或5’末端的堿基為胞嘧啶,該胞嘧啶用熒光染料標記。
5.根據權利要求3所述的基因突變檢測用探針,其中,所述熒光標記寡核苷酸位于從3’末端或5’末端起數第1~3位的任意位置。
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