[發明專利]染色體5p15區段SNP檢測特異性引物和液相芯片無效
| 申請號: | 201210105865.5 | 申請日: | 2012-04-11 |
| 公開(公告)號: | CN103374601A | 公開(公告)日: | 2013-10-30 |
| 發明(設計)人: | 許嘉森;劉志明 | 申請(專利權)人: | 廣州益善生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 萬志香 |
| 地址: | 510663 廣東省廣州市廣州科*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 染色體 p15 區段 snp 檢測 特異性 引物 芯片 | ||
1.一種染色體5p15區段SNP檢測液相芯片,其特征在于,包括有:(A).針對染色體5p15區段不同SNP位點分別設計的野生型和突變型的ASPE引物:每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因SNP位點的特異性引物序列組成,所述特異性引物序列為:針對C101T位點的SEQ?ID?NO.9及SEQ?IDNO.10,針對C107T位點的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12,針對C105A位點的SEQID?NO.13及SEQ?ID?NO.14,和/或針對C150T位點的SEQ?ID?NO.15及SEQ?IDNO.16;所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1~SEQ?ID?NO.8;
(B).包被有anti-tag序列的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列;所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.17~SEQID?NO.24,且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對;
(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應SNP位點的目標序列的引物。
2.根據權利要求1所述的染色體5p15區段SNP檢測液相芯片,其特征在于,所述擴增引物為:針對C101T位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26,針對C107T位點的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28,針對C105A位點的SEQ?ID?NO.29及SEQID?NO.30,和/或針對C150T位點的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32。
3.根據權利要求1所述的染色體5p15區段SNP檢測液相芯片,其特征在于,所述ASPE引物為:針對C101T位點的由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.9組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.10組成的序列,針對C107T位點的由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.11組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.12組成的序列,針對C105A位點的由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.13組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.14組成的序列,和/或針對C150T位點的由SEQ?ID?NO.7和SEQ?IDNO.15組成的序列及由SEQ?ID?NO.8和SEQ?ID?NO.16組成的序列。
4.根據權利要求1所述的染色體5p15區段SNP檢測液相芯片,其特征在于,(A).所述ASPE引物為:針對C101T位點的由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.9組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.10組成的序列,針對C107T位點的由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.11組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.12組成的序列,針對C105A位點的由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.13組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.14組成的序列,和針對C150T位點的由SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.15組成的序列及由SEQ?ID?NO.8和SEQ?ID?NO.16組成的序列;(B).包被有anti-tag序列的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列;所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.17~SEQID?NO.24,且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對;(C).所述擴增引物為:針對C101T位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26,針對C107T位點的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28,針對C105A位點的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30,和針對C150T位點的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32。
5.根據權利要求1-4任一項所述的染色體5p15區段SNP檢測液相芯片,其特征在于,所述間隔臂為5-10個T。
6.用于染色體5p15區段多態性檢測的特異性引物,其特征在于,所述特異性引物序列為:針對C101T位點的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10,針對C107T位點的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12,針對C105A位點的SEQ?ID?NO.13及SEQ?IDNO.14,和/或針對C150T位點的SEQ?ID?NO.15及SEQ?ID?NO.16。
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