[發明專利]一種PEB致病基因新突變及其應用

有效

• 申請號: 201210102926.2
• 申請日: 2012-04-10
• 公開（公告）號: CN103360490A
• 公開（公告）日: 2013-10-23
• 發明（設計）人: 蘇政;張清巖;陶錦勝;劉彥慧;商璇;王俊;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C07K14/78
• 分類號: C07K14/78;C12N15/12;C12Q1/68;G01N33/68
• 代理公司: 上海一平知識產權代理有限公司 31266
• 代理人: 趙向輝;雷芳

技術領域

本發明涉及生物醫學領域，具體地，本方面涉及一種PEB致病基因新突變及其應用。

背景技術

脛前型大皰性表皮松懈癥(Pretibial?Epidermolysis?Bullosa，PEB)是一種顯性營養不良性大皰性表皮松懈癥(Dominant?Dystrophic?Epidermolysis?Bullosa，DDEB)，其主要臨床特征是在雙下肢脛前區瘙癢，出現紅色丘疹、水皰，水皰愈合后形成萎縮性傷疤，指趾甲營養不良或融合，部分患者雙上肢和腹部也可見丘疹樣病變。PEB發病年齡是從出生到60歲，而這個家系的患者發病都在5歲以后，平均為10歲。家系外正常對照年齡是20-40歲，平均年齡30歲。

經研究發現，PEB疾病可能涉及到一種由編碼VII型膠原蛋白的COL7A1基因突變，從而導致錨纖維異常。但是目前PEB疾病的COL7A1基因突變譜尚未完全發現，基因型和表現型的關系也不明確。

因此本領域對脛前型大皰性表皮松懈癥病癥的研究尚不清晰，對造成該疾病的原因更不明了，因此本領域迫切需要對脛前型大皰性表皮松懈癥的致病機理進行研究。

發明內容

本發明的目的就是提供一種PEB致病基因新突變。

本發明的另一目的是提供所述突變的應用。

在本發明的第一方面，提供了一種突變的COL7A1蛋白，所述突變的COL7A1蛋白的第2034位氨基酸由甘氨酸(Gly)突變為纈氨酸(Val)。

在另一優選例中，所述突變的COL7A1蛋白的氨基酸序列如SEQ?ID?NO.：1所示。

在另一優選例中，所述突變的COL7A1蛋白除第2034位之外，其他部分與野生型COL7A1蛋白相同。

在另一優選例中，所述野生型COL7A1蛋白的氨基酸序列如SEQ?ID?NO.：2所示。

在本發明的第二方面，提供了一種編碼本發明第一方面所述突變的COL7A1蛋白的核苷酸序列。

在另一優選例中，所述的核苷酸序列除6101位外，其他部分與編碼野生型COL7A1蛋白的核苷酸序列相同。

在另一優選例中，所述的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.：3所示。

在另一優選例中，與編碼野生型COL7A1蛋白的核苷酸序列相比，編碼所述突變的COL7A1蛋白的核苷酸序列的第6101位核苷酸由G突變為T。

在另一優選例中，所述的編碼野生型COL7A1蛋白的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.：4所示。

在另一優選例中，本發明第一方面所述的突變的COL7A1蛋白或本發明第二方面所述的核苷酸序列來源于人或非人哺乳動物，較佳地來源于人。

在本發明的第三方面，提供了第一方面所述的COL7A1蛋白或第二方面所述核苷酸序列的用途，它們被用于制備檢測脛前型大皰性表皮松懈癥的試劑或試劑盒。

在另一優選例中，所述的試劑包括：引物或引物對、探針、抗體、或核酸芯片；

在另一優選例中，所述引物對可以特異性擴增出含6101位G的擴增產物，較佳地，擴增產物的長度為100-1000bp。

在另一優選例中，所述的探針可以特異性結合于含6101位突變的G的核酸片段。

在另一優選例中，所述的抗體可以特異性結合于含2034位突變的纈氨酸的多肽。

在本發明的第四方面，提供了一種檢測脛前型大皰性表皮松懈癥的試劑盒，所述的試劑盒包括：

(a)檢測COL7A1基因第6101位核苷酸位點的試劑；或檢測COL7A1蛋白第2034位氨基酸位點的試劑；

(b)說明書。

在另一優選例中，所述檢測COL7A1基因第6101位核苷酸位點的試劑，所述試劑選自下組：引物對、探針、核酸芯片。

在另一優選例中，檢測COL7A1蛋白第2034位氨基酸位點的試劑的試劑為抗體。

在另一優選例中，所述的引物對為：核苷酸序列如SEQ?ID?NO.：5的引物和核苷酸序列如SEQ?ID?NO.：6所示的引物組成的引物對。

在本發明的第五方面，提供了一種檢測樣本中COL7A1是否存在單核苷酸多態性(SNP)的方法，包括步驟：