[發(fā)明專利]一株可以調(diào)節(jié)人腸道菌群的益生菌及其檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210062066.4 | 申請日: | 2012-03-09 |
| 公開(公告)號: | CN102618459A | 公開(公告)日: | 2012-08-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 張佳超;王麗鳳;高鵬飛 | 申請(專利權(quán))人: | 北京和美科盛生物技術(shù)有限公司 |
| 主分類號: | C12N1/20 | 分類號: | C12N1/20;C12Q1/68;C12R1/25;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11129 | 代理人: | 李正清 |
| 地址: | 100102 北京市朝陽區(qū)*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 可以 調(diào)節(jié) 腸道 益生菌 及其 檢測 方法 | ||
1.一株可以調(diào)節(jié)人腸道菌群的益生菌,其特征在于所述益生菌(Lactobacillus?plantarum?P8)分離自內(nèi)蒙古牧民手工制作的酸奶中,保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物菌種保藏中心,保藏號:CGMCC?No.5468,保藏日期為:2011年11月18日。
2.可以調(diào)節(jié)人腸道菌群的益生菌的檢測方法,其特征是包括下列步驟:
(1)糞便樣品中宏基因組DNA的提取:
采用液氮凍融-CTAB法:取1.0g糞便樣品洗滌處理,將洗脫的菌體于1.5mL離心管中,立即置于液氮中完全凍結(jié),取出后放入65℃水浴中融化,反復(fù)凍融3次,加0.1mL?10%SDS和10.0μL?10mg/mL蛋白酶K,于37℃恒溫?fù)u床中200r/min搖動2h,室溫下12000g離心10min,收集上清液轉(zhuǎn)移至另一離心管中;上清液與等體積的氯仿于12000g離心10min,吸取上清液轉(zhuǎn)移至另一離心管中進(jìn)行酚氯仿抽提2次,經(jīng)0.1倍體積的醋酸鈉,1倍體積的冰異丙醇沉淀總DNA,然后70%乙醇洗滌沉淀2次,回溶備用;
(2)腸道優(yōu)勢菌群特異性引物設(shè)計(jì)
針對雙歧桿菌屬,擬桿菌門,所裝菌屬和奇異菌屬設(shè)計(jì)合成四組特異性引物,菌體引物信息見下表:
擴(kuò)增體系:
反應(yīng)體系50μL:10×PCR?Buffer?5μL,25mmo1/L?Mg2+1.0μL,2.5mmol/LdNTPs?4μL,5mmol/L上下游引物各2μL,DNA模板100ng左右,5U/μL?Taq酶(Promega)0.5uL,dd?H2O補(bǔ)足至50μL;
擴(kuò)增條件:
95℃變性5min;循環(huán)30次:95℃變性1min,退火45s,72℃延伸1min,然后72℃延伸7min,4℃保存;
(3)瓊脂糖凝膠電泳
將PCR產(chǎn)物于1%瓊脂糖凝膠中以5V/cm的電壓,電泳20-30min,EB染色,紫外拍照,檢測擴(kuò)增效果;
(4)外標(biāo)準(zhǔn)品的制備
應(yīng)用特異性引物擴(kuò)增雙歧桿菌屬,擬桿菌屬,普拉梭菌屬和奇異菌屬的特異性片段,檢測后膠回收各自片段達(dá)到純化的目的;而后將純化的片段和pMD-19T載體連接,連接后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,挑選陽性克隆子酶切驗(yàn)證,將驗(yàn)證過的陽性克隆子提取質(zhì)粒,測定濃度后計(jì)算拷貝數(shù)作為外標(biāo)準(zhǔn)品以供后續(xù)試驗(yàn)未知樣品中該菌屬的定量使用;
(5)RT-PCR檢測樣品中各個優(yōu)勢菌屬的數(shù)量
首先應(yīng)用上述外標(biāo)準(zhǔn)品制作各個菌屬的標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增曲線,然后以標(biāo)準(zhǔn)曲線為依據(jù),用各個菌屬的特異性引物定量檢測樣品中雙歧桿菌屬,擬桿菌屬,普拉梭菌屬和奇異菌屬的數(shù)量;
RT-PCR擴(kuò)增體系:
反應(yīng)體系20μL:10×PCR?mix?10μL,10mmol/L上下游引物各0.4μL,DNA模板100ng左右,dd?H2O補(bǔ)足至20μL;
RT-PCR擴(kuò)增條件:
95℃變性20s;循環(huán)40次:95℃變性5s,退火30s,72℃延伸35s。
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