[發(fā)明專利]一種核酸和鑒定真菌菌株致病型的方法以及試劑盒

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210052276.5
• 申請日: 2012-03-01
• 公開（公告）號: CN103255136A
• 公開（公告）日: 2013-08-21
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 戴小楓;李蕾;陳捷胤;陳相永;柳少燕;王金龍;肖紅利
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04
• 代理公司: 北京潤平知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11283
• 代理人: 王浩然;王鳳桐

1.一種核酸，該核酸具有SEQ?ID?NO：1或SEQ?ID?NO：2所示的序列，或者具有SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列，并且所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列在大麗輪枝菌(Verticillium?dahliae)的全基因組序列范圍內(nèi)僅存在于SEQ?ID?NO：1所示的序列中，所述SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列在大麗輪枝菌(Verticillium?dahliae)的全基因組序列范圍內(nèi)僅存在于SEQID?NO：2所示的序列中。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的核酸，其中，所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列的長度為100-5000bp。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的核酸，其中，所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列的長度為100-1000bp。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的核酸，其中，所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列的長度為100-500bp，優(yōu)選為150-250bp。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的核酸，其中，所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列的長度為15-99bp。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的核酸，其中，所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列的長度為18-50bp。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的核酸，其中，所述SEQ?ID?NO：1所示的序列中的特異性序列或SEQ?ID?NO：2所示的序列中的特異性序列的長度為20-40bp，優(yōu)選為22-35bp。

8.一種核酸，該核酸與權(quán)利要求1-7中任意一項(xiàng)所述的核酸互補(bǔ)。

9.一種鑒定真菌菌株致病型的方法，所述真菌菌株為大麗輪枝菌(Verticillium?dahliae)，該方法包括以下步驟：

(1)制備含有大麗輪枝菌的全基因組DNA的待測樣本；

(2)檢測所述待測樣本中是否存在第一分子標(biāo)記，所述第一分子標(biāo)記為根據(jù)權(quán)利要求1-8中任意一項(xiàng)所述的核酸；

(3)根據(jù)步驟(2)的檢測結(jié)果判斷真菌菌株致病型，在所述檢測結(jié)果顯示所述待測樣本中不存在所述第一分子標(biāo)記的情況下，則指示所述大麗輪枝菌菌株屬于高致病型；在所述檢測結(jié)果顯示所述待測樣本中存在具有SEQID?NO：1所示的序列的核酸或它的互補(bǔ)核酸，并且存在具有SEQ?ID?NO：2所示的序列的核酸或它的互補(bǔ)核酸的情況下，則指示該大麗輪枝菌菌株不屬于高致病型。

10.一種試劑盒，所述試劑盒含有根據(jù)權(quán)利要求8中任意一項(xiàng)所述的核酸，以及PCR試劑和/或分子雜交試劑。