[發(fā)明專利]AP3D1基因作為豬初生重性狀相關(guān)的分子標(biāo)記

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201210051534.8
• 申請(qǐng)日: 2012-03-01
• 公開（公告）號(hào): CN103289993A
• 公開（公告）日: 2013-09-11
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 余梅;李小平;趙書紅;梁躍;朱猛進(jìn);李長春;李新云;曹建華
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12N15/11
• 分類號(hào): C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務(wù)所 42001
• 代理人: 張紅兵

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于豬的分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種作為豬標(biāo)記輔助選擇的與初生重性狀相關(guān)的分子標(biāo)記的克隆及應(yīng)用。本發(fā)明的分子標(biāo)記與AP3D1基因有關(guān)。

背景技術(shù)

近年來，人們對(duì)豬肉的消費(fèi)量與日俱增，如何提高生產(chǎn)性能、降低生產(chǎn)成本成了豬育種工作者的工作重點(diǎn)之一。豬的初生重作為一個(gè)重要的繁殖性狀，與豬出生后的生長速度及育成率有著不可分割的密切聯(lián)系。豬場(chǎng)經(jīng)濟(jì)效益與初生重有非常強(qiáng)的正相關(guān)關(guān)系，也是豬場(chǎng)經(jīng)濟(jì)效益的第一限制性因素。最近有很多文獻(xiàn)報(bào)道了初生重對(duì)生長速度的影響，李劍豪(李劍豪.長白豬初生重對(duì)生長速度及哺育率的影響.仔豬生產(chǎn)[J].2006.18)研究發(fā)現(xiàn)長白豬60日齡重與35日齡重均與初生重呈正相關(guān)且初生重與生長速度呈正相關(guān)。Beaulieu等(Beaulieu?AD，Aalhus?JL，Williams?NH，Patience?JF.Impact?of?piglet?birth?weight，birth?order?and?litter?size?on?subsequent?growth?performance，carcass?quality，muscle?composition?and?eating?quality?of?pork[J].J?Anim?Sci.2010)研究發(fā)現(xiàn)，初生重較低的豬生長速度較慢，從而使其進(jìn)入市場(chǎng)的時(shí)間增加。另有研究表明仔豬的初生重與育成率亦悉悉相關(guān)，初生重在1.0Kg以下時(shí)仔豬育成率隨著初生重的增加而上升；初生重在1.0Kg以上時(shí)仔豬育成率沒有明顯的規(guī)律。初生重小于等于0.5Kg時(shí)仔豬育成率僅為55.56％(高建國.二花臉豬初生重對(duì)生長速度及育成率的影響[J].畜牧與獸醫(yī)，1992，24(1)：26)。大量調(diào)查數(shù)據(jù)證明，仔豬初生重1.5～1.6千克的豬場(chǎng)經(jīng)濟(jì)效益要比初生重1.2～1.3千克的豬場(chǎng)好得多。此外，科學(xué)家發(fā)現(xiàn)體重越輕的新生兒，其長大后患II型糖尿病、心血管疾病和高血壓的風(fēng)險(xiǎn)越大，有研究證明這一現(xiàn)象與基因的變異有關(guān)(Freathy等，Variants?in?ADCY5?and?near?CCNL1?are?associated?with?fetal?growth?and?birth?weight[J].Nat?Genet，2010，42(5)：430-435)。

因此，對(duì)豬初生重相關(guān)基因的克隆和鑒定可為解釋豬和其它哺乳動(dòng)物胎兒生長發(fā)育的遺傳機(jī)制提供重要線索，并為豬的繁殖性狀遺傳改良提供理論依據(jù)。尋找基因中的多態(tài)位點(diǎn)，通過與性狀間的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)基因與性狀間的關(guān)系是研究基因功能的一個(gè)重要手段，也是進(jìn)行標(biāo)記輔助選擇的基礎(chǔ)。AP3D1基因編碼接頭蛋白復(fù)合體AP3的一個(gè)亞基，該復(fù)合體參與細(xì)胞質(zhì)內(nèi)蛋白分選、轉(zhuǎn)運(yùn)小泡的形成以及溶酶體膜糖蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)(Le?Borgne?R，Alconada?A，Bauer?U，Hoflack?B.The?mammal?ian?AP-3?adaptor-like?complex?mediates?the?intracellular?transport?of?lysosomal?membrane?glycoproteins[J].J?Biol?Chem.1998，273(45)：29451-29461)。此外，AP3D1亞基與色素顆粒在細(xì)胞內(nèi)的發(fā)生與運(yùn)輸有關(guān)，并有可能與血小板致密顆粒及神經(jīng)遞質(zhì)的發(fā)生和運(yùn)輸有關(guān)(Danglot?L，Galli?T.What?is?the?function?of?neuronal?AP-3？[J].Biol?Cell.2007，99(7)：349-361)。以上研究證明，AP3D1基因參與多種生物學(xué)過程，可能與母體與胎兒間營養(yǎng)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和利用有關(guān)，因此，本研究擬探討AP3D1基因與豬初生重的關(guān)系，尋求獲得一種與豬初生重性狀相關(guān)的分子標(biāo)記。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于從AP3D1基因中克隆一種作為豬標(biāo)記輔助選擇的與初生重性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，揭示其在豬標(biāo)記特別是豬初生重性狀關(guān)聯(lián)分析中的應(yīng)用。

本發(fā)明通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)：

申請(qǐng)人從報(bào)道豬基因AP3D1克隆得到與豬初生重性狀相關(guān)基因的部分DNA片段，它的DNA序列如序列表SEQ?ID?NO：1和圖2所述。在序列表SEQ?ID?NO：1的第234bp處有一個(gè)A234-G234的堿基突變，導(dǎo)致BsrBI-RFLP多態(tài)性。這個(gè)堿基突變位于AP3D1基因第17內(nèi)含子中。

本發(fā)明所述的分子標(biāo)記的制備方法是：