[發明專利]一種評價轉基因植物安全性的方法有效
| 申請號: | 201210035564.X | 申請日: | 2012-02-16 |
| 公開(公告)號: | CN103257235A | 公開(公告)日: | 2013-08-21 |
| 發明(設計)人: | 王臺;鞏春燕;李琦 | 申請(專利權)人: | 中國科學院植物研究所 |
| 主分類號: | G01N33/68 | 分類號: | G01N33/68;G01N27/447;G01N27/62 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 關暢 |
| 地址: | 100093 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 評價 轉基因 植物 安全性 方法 | ||
1.一種評價轉基因植物安全性的方法,包括如下步驟:
(1)對待測樣本提取總蛋白,并進行2D-DIGE電泳和熒光圖像分析,獲取各個待測樣本的蛋白質組圖譜;所述待測樣本為樣本甲、樣本乙、樣本丙和樣本丁;所述樣本甲為待測轉基因植物;所述樣本乙為待測轉基因植物的親本植物;所述樣本丙為與樣本乙隸屬同一栽培種的不同植物;所述樣品丁為與樣本乙隸屬不同栽培種的植物;將所述樣本甲、所述樣本乙、所述樣本丙和所述樣本丁的總蛋白等質量混合,作為2D-DIGE電泳的內標;
(2)選取在70%以上的蛋白質圖譜中出現的蛋白進行主成分分析;
(3)根據所述主成分分析的結果進行判斷如下:如果所述樣本甲與所述樣本乙的差異性低于所述樣本乙與所述樣本丙的差異性且低于所述樣本乙和所述樣本丁的差異性,所述樣本甲為候選的安全的轉基因植物。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于:所述植物為水稻。
3.如權利要求2所述的方法,其特征在于:所述栽培種指的是粳亞種和秈亞種。
4.如權利要求1或2或3所述的方法,其特征在于:所述方法還包括如下步驟:
在內標的參照下,將所述樣本甲的蛋白質圖譜與所述樣本乙的蛋白質圖譜比較,選取表達量比值為1.2以上的蛋白進行質譜鑒定;在內標的參照下,將所述樣本乙的蛋白質圖譜與所述樣本丙的蛋白質圖譜比較,選取表達量比值為1.2以上的蛋白進行質譜鑒定;在內標的參照下,將所述樣本乙的蛋白質圖譜與所述樣本丁的蛋白質圖譜比較,選取表達量比值為1.2以上的蛋白進行質譜鑒定。
5.如權利要求4所述的方法,其特征在于:所述方法還包括將質譜鑒定后的蛋白進行功能分類和/或聚類分析和/或主成分分析和/或表達模式分析的步驟。
6.如權利要求3至5所述的方法,其特征在于:所述樣本甲、所述樣本乙和所述樣本丙屬于秈亞種;所述樣本丁屬于粳亞種。
7.如權利要求6所述的方法,其特征在于:所述樣本甲為轉基因水稻2036-1a;所述樣本乙為明恢86;所述樣本丙為明恢63;所述樣本丁為粳稻中花10號。
8.如權利要求6所述的方法,其特征在于:所述樣本甲為轉基因水稻Bar68-1;所述樣本乙為D68;所述樣本丙為明恢63;所述樣本丁為粳稻中花10號。
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