[發明專利]嗜肺軍團菌的基因分型芯片及檢測用試劑盒

有效

• 申請號: 201210003928.6
• 申請日: 2012-01-09
• 公開（公告）號: CN102424862A
• 公開（公告）日: 2012-04-25
• 發明（設計）人: 王磊;曹勃陽;姚芳芳;馮露;周光朋
• 申請（專利權）人: 南開大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C40B40/06;C12R1/01
• 代理公司: 天津市杰盈專利代理有限公司 12207
• 代理人: 朱紅星

1.一種檢測嗜肺軍團菌的基因芯片，包括固相載體和固定在該固相載體上的寡聚核苷酸探針，其特征在于該寡聚核苷酸探針包含下述DNA片段中的至少一種：

（1）嗜肺軍團菌O4、O12、O13、O15的wzm基因中所選取的至少一種DNA片段；

（2）嗜肺軍團菌O1、O2、O3、O5、O6、O7的wzt基因中所選取的至少一種DNA片段；

（3）嗜肺軍團菌O11的wecA基因中所選取的至少一種DNA片段；

（4）（1）或（2）或（3）中選取的DNA片段的互補DNA片段；

上述所述的固相載體為帶有活性基團的玻璃片。

2.權利要求1所述的基因芯片，其中所述寡聚核苷酸探針具有SEQ?ID?NO:1-23所示的核苷酸序列，或不同于SEQ?ID?NO:1-23但編碼的氨基酸序列與SEQ?ID?NO:1-23所編碼的氨基酸序列相同的核苷酸序列。

3.權利要求1或2所述的基因芯片，其中還包括正對照探針和負對照探針；具有SEQ?ID?NO:33-34所示的核苷酸序列。

4.權利要求1所述的基因芯片在制備檢測水體中菌嗜肺軍團菌11個血清型中至少一種致病菌的方面應用。

5.?權利要求1所述基因芯片的使用方法，其特征在于包含步驟：

（1）根據權利要求1所述病原菌的wzm基因、wzt基因和wecA?基因設計并合成用于PCR擴增的引物；

（2）制備待測樣品的基因組DNA，使用步驟（1）中的引物，對待測樣品基因組DNA進行PCR擴增，得到靶序列；

（3）標記步驟（2）中得到的靶序列；

（4）將標記后的靶序列與權利要求1所述的基因芯片雜交；

（5）用生物芯片掃描儀獲取雜交信號并分析雜交結果。

6.權利要求5所述的方法，其特征在于步驟（1）中所述的引物包括SEQ?ID?NO:?24-32所示的核苷酸序列的至少一種。

7.一種檢測嗜肺軍團菌的試劑盒，其特征在于包含權利要求2所述SEQ?ID?NO:1-23所示的核苷酸序列或其互補核苷酸序列的至少一種。

8.權利要求7所述的試劑盒，其特征在于還包含PCR擴增的引物，該引物具有SEQ?ID?NO:?24-32的核苷酸序列的至少一種。

9.根據權利要求8所述的試劑盒，其特征在于還包含雜交盒、雜交液。

10.?權利要求7所述的試劑盒在制備檢測嗜肺軍團菌O1、O2、O3、O4、O5、O6、O7、O11、O12、O13和O15?共11種血清型中至少一種致病菌方面的應用。