[發(fā)明專利]包括896C＞G突變的CYP2C9基因片段、所編碼的蛋白質(zhì)片段及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201110430271.7
• 申請(qǐng)日: 2011-12-19
• 公開（公告）號(hào): CN103031321A
• 公開（公告）日: 2013-04-10
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 蔡劍平;戴大鵬;徐仁愛;胡國新;楊麗萍
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 蔡劍平
• 主分類號(hào): C12N15/53
• 分類號(hào): C12N15/53;C12N15/11;C12Q1/68;C12N9/02
• 代理公司: 北京邦信陽專利商標(biāo)代理有限公司 11012
• 代理人: 王昭林

1.核酸片段，所述核酸片段包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1001位的突變位點(diǎn)，且是SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸，其中第1001位的核苷酸是G；或者所述核酸片段包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.2的第896位的突變位點(diǎn)，且是SEQ?ID?NO.2所示的核苷酸序列中的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸，其中第896位的核苷酸是G；或者為所述核酸片段的互補(bǔ)序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的核酸片段，其特征在于，所述核酸片段的長(zhǎng)度是10-100、100-200、200-500或500-1000個(gè)核苷酸；優(yōu)選地，所述核酸片段的長(zhǎng)度是10-20、20-30、30-40、40-50、50-60、60-100或100-300個(gè)核苷酸；進(jìn)一步優(yōu)選地，所述核酸片段是SEQ?ID?NO.1、2、24-27所示的序列。

3.等位基因特異性寡核苷酸，所述寡核苷酸與含有對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1001位或?qū)?yīng)于SEQ?ID?NO.2的第896位的突變位點(diǎn)的等位基因片段或其互補(bǔ)序列全部或部分雜交，其中SEQ?ID?NO.1的第1001位或SEQ?ID?NO.2的第896位的突變位點(diǎn)的核苷酸是G；所述等位基因片段是SEQ?ID?NO.1或SEQ?ID?NO.2所示的核苷酸序列中的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸或其互補(bǔ)序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的等位基因特異性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是探針或引物；優(yōu)選地，當(dāng)所述寡核苷酸是探針時(shí)，所述寡核苷酸的長(zhǎng)度是5-100個(gè)核苷酸；當(dāng)所述寡核苷酸是引物時(shí)，所述寡核苷酸的長(zhǎng)度是15-40個(gè)核苷酸；優(yōu)選地，當(dāng)所述寡核苷酸是探針時(shí)，所述突變位點(diǎn)位于探針序列的中心或大約中心處；當(dāng)所述寡核苷酸是引物時(shí)，所述突變位點(diǎn)位于引物的3’末端。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所示的等位基因特異性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是如SEQ?ID?NO.28-33所示的序列。

6.用于檢測(cè)和/或分析單堿基突變的試劑盒，包括權(quán)利要求1或2所述的核酸片段和/或權(quán)利要求3-5任一項(xiàng)所述的等位基因特異性寡核苷酸；或者包含SEQ?ID?NO.10和/或SEQ?ID?NO.11和/或SEQ?ID?NO.20所示的序列片段。

7.權(quán)利要求1或2所述的核酸片段和/或權(quán)利要求3-5任一項(xiàng)所述的等位基因特異性寡核苷酸在檢測(cè)CYP2C9基因突變中的應(yīng)用，其中所述核酸片段或寡核苷酸用作探針或引物。

8.一種用藥指導(dǎo)，包括檢測(cè)待測(cè)樣品中CYP2C9基因的對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1001位或SEQ?ID?NO.2的第896位的單堿基突變；根據(jù)檢測(cè)到的突變，調(diào)整經(jīng)CYP2C9代謝的藥物的給藥量；優(yōu)選地，所述藥物是環(huán)磷酰胺、異環(huán)磷酰胺、紫杉醇、華法林、醋硝香豆素、美芬妥英、甲苯磺丁脲、那格列奈、吡格列酮、羅格列酮、苯妥英、唑尼沙胺、阿莫地喹、鹽酸氯胍、奎寧、阿米替林、西酞普蘭、丙咪嗪、哌羅匹隆、舍曲林、硫利達(dá)嗪、文拉法辛、氯沙坦、厄貝沙坦、纈沙坦、雙氯芬酸、氨基比林、安替比林、塞來昔布、氟比洛芬、布洛芬、吲哚美辛、氯諾昔康、甲芬那酸、萘普生、吡羅昔康、替諾昔康、洛哌丁胺、美沙酮、嗎啡、蘭索拉唑、奧美拉唑、氯巴占、甲苯比妥或佐匹克隆。

9.一種分析核酸的方法，包括分析待測(cè)樣品中的包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的序列的核酸中對(duì)應(yīng)于第1001位的核苷酸或分析待測(cè)樣品中的包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.2的序列的核酸中對(duì)應(yīng)于第896位的核苷酸；優(yōu)選地，所述方法是測(cè)序法或探針雜交法。

10.CYP2C9蛋白或其片段或變異體，所述蛋白序列為SEQ?ID?NO.3所示的序列；所述片段或變異體包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.3的第299位的精氨酸，并且為SEQ?ID?NO.3所示的氨基酸序列的至少10個(gè)連續(xù)氨基酸。