[發明專利]分子動力學計算的實現方法和裝置

在審

• 申請號: 201110403579.2
• 申請日: 2011-12-06
• 公開（公告）號: CN103150463A
• 公開（公告）日: 2013-06-12
• 發明（設計）人: 何牧君;何滄平;馬少杰;陳偉;占杰;李斌;吳宏文;顧小寶;曹征
• 申請（專利權）人: 曙光信息產業股份有限公司
• 主分類號: G06F19/00
• 分類號: G06F19/00
• 代理公司: 北京德恒律師事務所 11306
• 代理人: 陸鑫;房嶺梅

1.一種分子動力學計算的實現方法，其特征在于，包括：

接收用戶通過圖形化界面輸入的計算任務；

將所述計算任務中需要計算的數據分配給圖形處理器GPU和中央處理器CPU；

所述GPU和所述CPU根據分子動力學的計算方法，對各自分配到的所述需要計算的數據進行分子動力學計算。

2.根據權利要求1所述的實現方法，其特征在于，將需要計算的數據分配給GPU和CPU包括：

根據所述GPU和所述CPU的處理能力，對所述GPU和所述CPU分別分配需要處理的數據。

3.根據權利要求2所述的實現方法，其特征在于，將需要計算的數據分配給GPU和CPU包括：

將需要計算的數據分批次分配給所述GPU和所述CPU。

4.根據權利要求3所述的實現方法，其特征在于，進一步包括：

在所述GPU和所述CPU進行分子動力學計算的過程中，根據所述GPU和所述CPU的處理能力的變化情況，動態調整每批次對所述GPU和所述CPU分配的需要計算的數據量。

5.根據權利要求4所述的實現方法，其特征在于，在首次分配需要計算的數據給所述GPU和所述CPU的情況下，所述方法進一步包括：

通過應用程序編程接口API獲取所述GPU的標稱處理能力。

6.根據權利要求1至5中任一項所述的實現方法，其特征在于，所述CPU的數量為至少一個；所述GPU的數量為至少一個。

7.一種分子動力學計算的實現裝置，其特征在于，包括：

至少一個CPU；

至少一個GPU；

界面提供模塊，用于提供圖形化界面，并接收用戶通過所述圖形化界面輸入的計算任務；

分配模塊，用于將所述計算任務中需要計算的數據分配給所述GPU和所述CPU；

并且，所述GPU和所述CPU用于根據分子動力學的計算方法，對各自分配到的所述需要計算的數據進行分子動力學計算。

8.根據權利要求7所述的實現裝置，其特征在于，所述分配模塊進一步用于根據所述GPU和所述CPU的處理能力，對所述GPU和所述CPU分別分配需要處理的數據。

9.根據權利要求8所述的實現裝置，其特征在于，所述分配模塊進一步用于將需要計算的數據分批次分配給所述GPU和所述CPU。

10.根據權利要求9所述的實現裝置，其特征在于，所述分配模塊進一步用于在所述GPU和所述CPU進行分子動力學計算的過程中，根據所述GPU和所述CPU的處理能力的變化情況，動態調整每批次對所述GPU和所述CPU分配的需要計算的數據量。