[發明專利]抗結核抑制劑篩選的靶標基因Rv2498c及應用

無效

• 申請號: 201110373808.0
• 申請日: 2011-11-21
• 公開（公告）號: CN103122364A
• 公開（公告）日: 2013-05-29
• 發明（設計）人: 何正國;崔濤;曾菊梅
• 申請（專利權）人: 華中農業大學
• 主分類號: C12Q1/18
• 分類號: C12Q1/18;C12N15/60;C12N9/88
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務所 42001
• 代理人: 張紅兵

1.結核分枝桿菌基因Rv2498c在篩選抗結核抑制劑靶標中的應用，其特征在于，該基因的核苷酸序列如序列表SEQ.ID?NO：1所示。

2.結核分枝桿菌基因Rv2498c在篩選抗結核抑制劑靶標中的應用，其特征在于，該基因編碼的蛋白質的序列如序列表SEQ.ID?NO：2所示。

3.如權利要求1或2所述的一種結核分枝桿菌Rv2498c基因作為藥物靶標的應用，其特征在于包含以下步驟：

(1)從PBD蛋白質數據庫獲得結核分枝桿菌Rv2498c蛋白質結構，Rv2498c蛋白質與草酰乙酸離子復合物結合的空腔被選作對接化合物的活性位點；

(2)建立針對結核分枝桿菌Rv2498c的計算機藥物篩選系統；

(3)運用步驟(2)的計算機藥物篩選系統針對結核分枝桿菌Rv2498c蛋白質活性位點，從ZINC數據庫中篩選出20個與結核分枝桿菌Rv2498c活性位點有高親和力的化合物；

(4)利用小分子化合物進行抑菌試驗，測定有抑菌活性的小分子的最小抑菌濃度；

其中：

步驟(1)中的結核分枝桿菌Rv2498c蛋白質的序列如序列表SEQ?ID?NO：2所示；

步驟(3)的20個與結核分枝桿菌Rv2498c活性位點有高親和力的化合物如下所述，且具有以下特征：

化合物43#

英文名稱：6-(3，4-dihydro-2(1H)-isoquinolinyl)hexylamine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC02029199；

化合物44#

英文名稱：6-(1-piperidinyl)hexylamine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC02029173；

化合物46#

英文名稱：2-(4-imidazo[1，2-a]pyridin-2-ylbenzylidene)hydrazinecarboximidamide

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC00337551；

化合物47#

英文名稱：6-(4-{2-[amino(imino)methyl]carbohydrazonoyl}phenyl)-7-methylimidazo[2，1-b][1，3]thiazol-7-ium

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC00337555；

化合物64#

英文名稱：

2-(1，3-benzoxazol-2-yl)-3-(1，3，5-triazatricyclo[3.3.1.1～3，7～]dec-7-ylamino)acrylaldehyde

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC19329936；

化合物65#

英文名稱：2-amino-4-(4-chloroanilino)-6-oxo-1，6-dihydro-5-pyrimidinylformamide

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC04938764；

化合物66#

英文名稱：-anilino-6-piperidin-1-yl-1，3，5-triazin-2(1H)-one?hydrazone

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC34633360；

化合物67#

英文名稱：N-{3-[[(acetyloxy)imino](amino)methyl]thien-2-yl}acetamide

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC17111243；

化合物68#

英文名稱：N～6～-[(2，2，2-trichloroethoxy)carbonyl]lysine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC02028782；

化合物69#

英文名稱：4-(methylsulfanyl)-1H-imidazo[4，5-d]pyridazin-7-yl?hydrosulfide

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC18096847；

化合物70#

英文名稱：N-allyl-N-[3-(allylimino)-1，4-dihydro-2-quinoxalinylidene]amine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC13281923；

化合物71#

英文名稱：N-phenyl-N-(3-(phenylimino)-1，4-benzodithiin-2(3H)-ylidene)amine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC17255860；

化合物72#

英文名稱：

4-methylspiro(pentacyclo[4.3.0.0～2，5～.0～3，8～.0～4，7～]nonane-9，2′-[1，3]-dioxolane)-1-ylamine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC04085800；

化合物73#

英文名稱：6-(1-pyrrolidinyl)hexylamine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC02029191；

化合物74#

英文名稱：2-(2-benzyl-1H-indol-3-yl)ethanamine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC00332045；

化合物75#

英文名稱：2-{2-[amino(imino)methyl]carbohydrazonoyl}-1-methylimidazo[1，2-a]pyridin-1-ium

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC00337558；

化合物76#

英文名稱：3-{4-[6-(3-oxo-1-propenyl)imidazo[1，2-a]pyridin-2-yl]phenyl}acrylaldehyde

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC17111559；

化合物77#

英文名稱：5-hydrazino-3-methyl-1H-pyrazole-4-carbohydrazide

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC00967162；

化合物78#

英文名稱：2-hydroxy-N-(2-piperazin-1-ylethyl)benzamide

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC19901616；

化合物79#

英文名稱：N″-(5-chloro-2-hydroxybenzoyl)N-(2-phenylethyl)guanidine

結構式：

化合物在ZINC數據庫中的編號：ZINC04087190；

其中

步驟(4)測定有抑菌活性的小分子化合物66#的最小抑菌濃度分別如下：

結核分枝桿菌??????4μg/ml；

牛結核分枝桿菌????2～4μg/ml；

步驟(4)測定有抑菌活性的小分子化合物即抑制劑70#的最小抑菌濃度分別如下：

結核分枝桿菌??????8μg/ml；

牛結核分枝桿菌????8μg/ml。