[發(fā)明專(zhuān)利]用于檢測(cè)小鼠呼腸孤病毒Ⅲ型的引物、探針及其方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201110340710.5 | 申請(qǐng)日: | 2011-11-02 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN102337357A | 公開(kāi)(公告)日: | 2012-02-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 譚淑萍;李萃;王剛;蔣立新;周志文 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 舒泰神(北京)生物制藥股份有限公司 |
| 主分類(lèi)號(hào): | C12Q1/70 | 分類(lèi)號(hào): | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 暫無(wú)信息 | 代理人: | 暫無(wú)信息 |
| 地址: | 100176 北京*** | 國(guó)省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 檢測(cè) 小鼠 呼腸孤 病毒 引物 探針 及其 方法 | ||
1.用于檢測(cè)小鼠呼腸孤病毒III型的引物,其特征在于,所述引物是由具有序列表中的SEQ?ID?NO:1的上游引物與具有序列表中的SEQ?IDNO:2的下游引物組成的一對(duì)寡核苷酸。
2.一種與權(quán)利要求1所述引物配合使用的探針,其特征在于,所述探針具有序列表中的SEQ?ID?NO:3的核苷酸序列。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的探針,其特征在于,所述探針5’端連接有熒光報(bào)告基團(tuán),3’端連接有熒光淬滅基團(tuán)。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的探針,其特征在于,所述熒光報(bào)告基團(tuán)選自FAM、VIC、JOE、HEX中的任意一種,所述熒光淬滅基團(tuán)選自TAMRA或Eclipse。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的探針,其特征在于,所述熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM,所述熒光淬滅基團(tuán)為T(mén)AMRA。
6.一種用于檢測(cè)小鼠呼腸孤病毒III型的方法,其特征在于,所述方法使用權(quán)利要求1中所述的引物及權(quán)利要求2~5任一所述的探針進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,所述實(shí)時(shí)熒光定量PCR的反應(yīng)體系還包括RT-PCR擴(kuò)增試劑、陽(yáng)性RNA標(biāo)準(zhǔn)品、酵母tRNA稀釋液、陰性質(zhì)控品、空白對(duì)照。
8.根據(jù)權(quán)利要求6或7所述的方法,其特征在于,所述實(shí)時(shí)熒光定量PCR的退火溫度為60℃。
9.根據(jù)權(quán)利要求6~8任一所述的方法,其特征在于,所述實(shí)時(shí)熒光定量PCR的反應(yīng)條件為:48℃,15min;95℃,10min;95℃,15sec,60℃,40sec,共40個(gè)循環(huán)。
10.根據(jù)權(quán)利要求6~9任一所述的方法,其特征在于,所述方法還包括標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立,方法為:擴(kuò)增含序列表中SEQ?ID?NO:4所示的堿基同源序列的pMD18-T載體,得到190bp的DNA片段,體外轉(zhuǎn)錄所述DNA片段并純化獲得的RNA作為陽(yáng)性RNA標(biāo)準(zhǔn)品,將其十倍稀釋成不同濃度的陽(yáng)性定量標(biāo)準(zhǔn)品,以所述陽(yáng)性定量標(biāo)準(zhǔn)品作為模板進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),得到檢測(cè)小鼠呼腸孤病毒III型的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
11.一種檢測(cè)小鼠呼腸孤病毒III型的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒含有權(quán)利要求1中所述的引物及權(quán)利要求2~5任一所述的探針。
12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的反應(yīng)體系還包括RT-PCR擴(kuò)增試劑、陽(yáng)性RNA標(biāo)準(zhǔn)品、酵母tRNA稀釋液、陰性質(zhì)控品、空白對(duì)照。
13.根據(jù)權(quán)利要求12所述的試劑盒,其特征在于,所述RT-PCR擴(kuò)增試劑為2×Taqman?PCR?Mix、40×Taqman?RT-Enzyme?MIX。
14.根據(jù)權(quán)利要求12或13所述的試劑盒,其特征在于,所述陽(yáng)性RNA標(biāo)準(zhǔn)品通過(guò)下述方法獲得:擴(kuò)增含序列表中SEQ?ID?NO:4所示的堿基同源序列的pMD18-T載體,得到190bp的DNA片段,體外轉(zhuǎn)錄所述DNA片段并純化獲得的RNA即標(biāo)準(zhǔn)品。
15.權(quán)利要求1中所述的引物或權(quán)利要求2~5任一所述的探針在檢測(cè)鼠源生物制品中呼腸孤病毒III型殘留時(shí)的應(yīng)用。
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