[發(fā)明專利]與玉米株高性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn)

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201110333262.6
• 申請(qǐng)日: 2011-10-28
• 公開（公告）號(hào): CN102373278A
• 公開（公告）日: 2012-03-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李建生;高玉峰;嚴(yán)建兵;邢安琪;張衛(wèi)平;鄭艷萍;楊小紅
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 關(guān)暢

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一個(gè)玉米株高基因Br2的兩個(gè)等位基因，及它們內(nèi)部功能位點(diǎn)、所編碼蛋白及在作物遺傳育種及生上應(yīng)用。

背景技術(shù)

玉米不僅是重要的糧食作物，也是重要的飼料來(lái)源和工業(yè)原料，同時(shí)作為C4作物的玉米還是重要的能源作物。隨著耕地面積的不斷減少，增加單位面積的產(chǎn)量是增加玉米產(chǎn)量的首要選擇，而單位面積種植密度的增加則是提高單產(chǎn)的最重要的途徑。因此，改良玉米的株型以提高種植密度是玉米遺傳育種的重要方向，而株高的適度降低在調(diào)控株型中起著至關(guān)重要的作用。矮化品種的采用曾使水稻、小麥等作物的產(chǎn)量有了飛躍性提高，引發(fā)了第一次綠色革命；而目前在玉米中被克隆的株高基因，大多來(lái)自于表型極端的突變體，對(duì)其它農(nóng)藝性狀影響過(guò)大，很難廣泛應(yīng)用于生產(chǎn)。近年來(lái)，隨著分子生物學(xué)的迅速發(fā)展，許多控制株高的QTL被定位，分析和研究其機(jī)理并通過(guò)分子生物學(xué)手段適度調(diào)整株型成為玉米遺傳改良的重要突破口。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的一個(gè)目的是提供一種用于鑒定玉米株高的引物對(duì)，或者說(shuō)提供一種用于鑒定下述SNP位點(diǎn)的引物對(duì)。

本發(fā)明所提供的用于鑒定玉米株高的引物對(duì)，為如下(1)或(2)所示：

(1)第一條引物序列為：SEQ?ID?NO：3；第二條引物序列為：SEQ?ID?NO：4；第三條引物序列為：SEQ?ID?NO：5；

(2)第一條引物序列為：SEQ?ID?NO：6；第二條引物序列為：SEQ?ID?NO：7。

上述任一所述引物對(duì)在鑒定玉米株高中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

上述任一所述引物對(duì)在鑒定玉米基因組中權(quán)利要求3所述SNP位點(diǎn)中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

上述任一所述引物對(duì)在玉米選擇育種中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

本發(fā)明的另一個(gè)目的是提供一個(gè)與玉米株高性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn)。

本發(fā)明所提供的與玉米株高性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn)，為SEQ?ID?NO：1中自5′末端起第5248位核苷酸，所述SEQ?ID?NO：1中自5′末端起第5248位核苷酸位于玉米基因組中玉米矮稈突變體基因br2的第5個(gè)外顯子內(nèi)；所述第5248位核苷酸為T。

上述SNP位點(diǎn)在鑒定玉米株高中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

上述SNP位點(diǎn)在玉米選擇育種中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

本發(fā)明的另一個(gè)目的是提供一種與玉米株高性狀相關(guān)的DNA片段。

本發(fā)明所提供的與玉米株高性狀相關(guān)的DNA片段，為如下甲或乙所示：

甲：SEQ?ID?NO.1中自5’末端起第4331位至第5957位核苷酸所示DNA片段；

乙：將SEQ?ID?NO.1中自5’末端起第4331位至第5957位核苷酸所示DNA進(jìn)行任意突變得到的突變后DNA；所述突變后的DNA片段具有降低玉米株高但不影響玉米產(chǎn)量的功能。

上述SNP位點(diǎn)或上述DNA片段在調(diào)節(jié)玉米株高中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

本發(fā)明的最后一個(gè)目的是提供一種用于擴(kuò)增上述SNP位點(diǎn)的引物對(duì)。

本發(fā)明所提供的用于擴(kuò)增上述SNP位點(diǎn)的引物對(duì)，為如下(1)或(2)所述：

(1)SEQ?ID?NO：8和SEQ?ID?NO：9所示DNA分子；

(2)SEQ?ID?NO：10和SEQ?ID?NO：11所示DNA分子。

本發(fā)明通過(guò)大量實(shí)驗(yàn)研究，發(fā)現(xiàn)了一個(gè)影響玉米株高但不影響玉米產(chǎn)量的SNP位點(diǎn)，進(jìn)一步開發(fā)了鑒定該SNP位點(diǎn)的引物對(duì)。應(yīng)用本發(fā)明的SNP位點(diǎn)及引物對(duì)可以在玉米早期事先鑒定玉米株高，而不用等到玉米成熟后通過(guò)表型鑒定株高。本發(fā)明SNP位點(diǎn)及引物對(duì)加快了玉米育種進(jìn)程，在玉米的選擇育種領(lǐng)域有廣闊的應(yīng)用前景。

附圖說(shuō)明

圖1為QTL-qPH1區(qū)段近等基因系(NIL_88/279)的構(gòu)建示意圖。

圖2為qPH1基因結(jié)構(gòu)。

圖3為155份關(guān)聯(lián)群體測(cè)序引物位置示意圖(其中P1，P2和P3，P4兩對(duì)引物擴(kuò)增區(qū)段在基因中有一段交叉)。

圖4為目標(biāo)基因的蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。

圖5為用分子標(biāo)記擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)結(jié)果。

具體實(shí)施方式

下述實(shí)施例中所使用的實(shí)驗(yàn)方法如無(wú)特殊說(shuō)明，均為常規(guī)方法。