[發明專利]預測原發性肝癌轉移潛力的基因標志物

無效

• 申請號: 201110326402.7
• 申請日: 2011-10-24
• 公開（公告）號: CN103060312A
• 公開（公告）日: 2013-04-24
• 發明（設計）人: 何祥火;魏霖;梁琳慧;顧健人
• 申請（專利權）人: 上海市腫瘤研究所
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 陳靜

技術領域

本發明屬于醫藥學領域；更具體地，本發明涉及預測原發性肝癌轉移潛力的基因標志物。

背景技術

任何事物的發生發展都處于內外因共同作用之下，內因為主，外因為輔。基因作為生命的遺傳介質，在生物體的生、老、病、死中處于基礎內因的地位。絕大部分基因通過轉錄生成核糖核酸，再翻譯生成蛋白質而發揮生物學功能。基因的功能雖然主要是通過蛋白質來體現，但仍可以通過基因的轉錄產物mRNA的含量而部分反映。

全基因組表達譜芯片含2萬余個探針，利用DNA雙鏈同源互補的原理在全基因組水平上檢測樣本中所含各種mRNA的含量，因此可在同一時間對待測樣本中全基因組范圍內的基因的轉錄水平進行檢測，進而推測基因功能。

原發性肝癌是中國最常見的惡性腫瘤之一，其惡性程度高，發展迅速，治療困難，病死率高。因此，肝癌的盡早診斷就愈發顯得迫切。

然而，迄今為止，本領域對于與原發性肝癌密切相關的基因了解甚少，因此本領域迫切需要進一步地分離各種與原發性肝癌密切相關的基因，找到對于診斷肝癌的發生、轉移、復發或檢測有關的基因標志物。

發明內容

本發明的目的在于提供預測原發性肝癌轉移潛力的基因標志物。

在本發明的第一方面，提供一種多核苷酸集，所述的多核苷酸集包括編碼以下蛋白的多核苷酸(較佳地，由編碼以下蛋白的多核苷酸組成)：

可溶性運載蛋白家族成員25，脂肪酸去飽和酶，Retbindin，CDK5調節亞基結合蛋白2，谷胱甘肽硫轉移酶mu?2，腫瘤蛋白p53誘導的核蛋白2，跨膜蛋白123，谷胱甘肽硫轉移酶mu?1，ArfGAP3，與酵母ATG2自噬相關蛋白2同源的蛋白A，與果蠅巨大幼蟲致死基因同源的蛋白2，Kruppel樣因子13，輔酶脫氫酶1?alpha子基1和KIAA0649蛋白。

在一個優選例中，所述的多核苷酸集包括：序列如SEQ?ID?NO：1-14所示的14種多核苷酸。

在本發明的另一方面，提供所述的多核苷酸集的用途，用于制備測定(或預測)原發性肝癌患者的肝癌轉移情況或轉移潛力的檢測試劑或試劑盒。

在另一優選例中，所述的試劑是特異性擴增所述的多核苷酸集中各多核苷酸的引物對；或是特異性識別所述的多核苷酸集中各多核苷酸的探針。

在本發明的另一方面，提供一種用于測定(或預測)原發性肝癌患者的肝癌轉移情況或轉移潛力的試劑，其是特異性識別序列如SEQ?ID?NO：n所示的多核苷酸的探針，所述的探針的核苷酸序列如SEQ?ID?NO：n+14所示；其中n為選自1-14的正整數。

在本發明的另一方面，提供一種基因芯片，所述的基因芯片包括：

固相載體；以及

有序固定在所述固相載體上的探針，所述的探針特異性地對應于SEQ?IDNO：n所示的序列，其中n為選自1-14的正整數。

在另一優選例中，所述的探針是特異性識別序列SEQ?ID?NO：n所示的多核苷酸的探針，所述的探針的核苷酸序列如SEQ?ID?NO：n+14所示。

在另一優選例中，所述的探針含有：互補結合區和/或與固相載體相連的連接區。

在本發明的另一方面，提供所述的基因芯片的用途，用于制備測定(或預測)原發性肝癌患者的肝癌轉移情況或轉移潛力的試劑盒。

在本發明的另一方面，提供一種測定(或預測)原發性肝癌患者的肝癌轉移情況或轉移潛力的試劑盒，所述的試劑盒中含有所述的基因芯片。

在另一優選例中，所述的試劑盒中還包括：核酸抽提液、顯色液或雜交液。

本發明的其它方面由于本文的公開內容，對本領域的技術人員而言是顯而易見的。

附圖說明

圖1、以MDS算法轉換后的已發生轉移肝癌樣本(紅色點或淺色點)和未發生轉移肝癌樣本(藍色點或深色點)在三維空間內的散點圖。

具體實施方式

本發明人通過檢測兩種肝癌患者來源的(分別為腫瘤切除手術后在觀察期內腫瘤“已發生轉移的”和“未發生轉移的”患者)原發性肝癌的癌組織樣本的基因表達譜水平，用統計學方法，首次從中篩選出14個特異性的基因。經檢驗證明，這些特異性的基因標志物可非常有效地用于區分原發性肝癌的高轉移潛力樣本和低轉移潛力樣本。

基因標志物及其用途