[發明專利]用于鑒別水稻秈亞種生態型的引物組合物及其應用

無效

• 申請號: 201110271841.2
• 申請日: 2011-09-14
• 公開（公告）號: CN102296123A
• 公開（公告）日: 2011-12-28
• 發明（設計）人: 李自超;張冬玲;張洪亮;王美興;王鳳梅;宋立瑩;馬占峰
• 申請（專利權）人: 中國農業大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

技術領域

本發明涉及一種用于鑒別水稻秈亞種生態型的引物組合物及其應用。

背景技術

水稻(Oryza?sativa?L.)是世界上最重要的糧食作物之一。中國作為亞洲栽培稻的起源地之一(Oka?1988)，擁有豐富的稻種資源。目前，國家種質資源庫收集保存栽培稻7萬余份，其中秈稻種質資源占67％(ICGR?CAAS?1996)。我國秈稻種植面積占水稻總面積的70％，而且，秈稻是實現雜交化程度最高的水稻，雜交秈稻種植面積已占中國秈稻面積的近80％。因此，秈稻在我國水稻研究和生產實踐中具有重要的地位。

栽培稻的分類一直受到各國科學家的高度重視，國內外學者相繼提出了多種分類體系。秈、粳是亞洲栽培稻遺傳分化的主流，已有了比較一致的認識。每個亞種內的遺傳分化及分類卻一直沒有一致的意見。

進入20世紀80年代以來，我國雜交稻產量徘徊不前，其中最主要的原因是親本的遺傳基礎狹窄，而拓寬雜交稻親本間的遺傳差異，可以在一定程度上提高組合的優勢強度。然而，根據不同地區的生態條件所劃分的生態類型無法有效反映親本間的遺傳差異，對雜種優勢的預測效果不理想。另外，水稻中秈、粳亞種間雜種優勢的利用已得到廣泛的關注，但是，由于存在F1代半不育等諸多問題，亞種間雜種優勢一直難以直接利用，亞種內不同生態類型間的雜種優勢利用已成為育種家的共識。但是，有關合理、可行的亞種內生態型的劃分研究較少。

亞種內不同生態型間雜種優勢的利用已成為雜交稻進入更高發展階段，開展超高產育種的一個主要方向。要進行秈稻亞種內不同生態型間雜種優勢的超高產育種，首先要正確判別能夠反映品種間遺傳差異的生態型。然而，大量育成品種由于廣泛雜交而具有復雜的血緣，對這些品種的分類是栽培稻分類的新任務。

發明內容

本發明的目的是提供一種用于鑒別水稻秈亞種生態型的引物組合物及其應用。

本發明提供的輔助鑒別水稻秈亞種生態型的引物組合物，由rm216引物對、rm225引物對、rm235引物對、rm25引物對、rm23引物對、rm244引物對、rm253引物對、rm267引物對、rm296引物對、rm223引物對和rm258引物對組成；

所述rm216引物對為序列表的序列1所示DNA(上游引物)和序列表的序列2所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm225引物對為序列表的序列3所示DNA(上游引物)和序列表的序列4所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm235引物對為序列表的序列5所示DNA(上游引物)和序列表的序列6所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm25引物對為序列表的序列7所示DNA(上游引物)和序列表的序列8所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm23引物對為序列表的序列9所示DNA(上游引物)和序列表的序列10所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm244引物對為序列表的序列11所示DNA(上游引物)和序列表的序列12所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm253引物對為序列表的序列13所示DNA(上游引物)和序列表的序列14所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm267引物對為序列表的序列15所示DNA(上游引物)和序列表的序列16所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm296引物對為序列表的序列17所示DNA(上游引物)和序列表的序列18所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm223引物對為序列表的序列19所示DNA(上游引物)和序列表的序列20所示DNA(下游引物)組成的引物對；所述rm258引物對為序列表的序列21所示DNA(上游引物)和序列表的序列22所示DNA(下游引物)組成的引物對。

所述水稻秈亞種生態型可為早秈生態型、中間型生態型或晚秈生態型。

所述引物組合物中的每條引物在合成時，可以引入各種標記，如熒光標記。

所述引物組合物可用于輔助鑒別水稻秈亞種生態型。所述水稻秈亞種生態型可為早秈生態型、中間型生態型或晚秈生態型。

所述的引物組合物可用于制備輔助鑒別水稻秈亞種生態型的試劑盒。所述水稻秈亞種生態型可為早秈生態型、中間型生態型或晚秈生態型。

本發明還保護一種輔助鑒別水稻秈亞種生態型的試劑盒，含有所述引物組合物。所述水稻秈亞種生態型可為早秈生態型、中間型生態型或晚秈生態型。所述試劑盒中，還可包括用于提取基因組DNA的試劑和/或用于PCR擴增的試劑。所述試劑盒中的各個組分可為液體，也可為凍干粉。