[發明專利]一種STK11基因突變檢測特異性引物和液相芯片

有效

• 申請號: 201110269826.4
• 申請日: 2011-09-13
• 公開（公告）號: CN102994623A
• 公開（公告）日: 2013-03-27
• 發明（設計）人: 許嘉森;甘丹翠;鄒鳳文
• 申請（專利權）人: 廣州益善生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 萬志香;曾旻輝

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，涉及醫學和生物技術，具體的是涉及一種STK11基因突變檢測特異性引物和液相芯片。

背景技術

目前，對STK11基因突變進行檢測和分析的方法很少，主要有直接測序法和PCR-RFLP分析法，其中最常用的方法有PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP法是基于基因突變造成的限制性內切酶識別位點的改變，如位點丟失或產生新位點，通過PCR擴增某一特定片段，再用限制性內切酶酶切擴增產物，電泳觀察片段的大小，這種方法用于檢測酶切位點改變的基因突變，可直接判斷基因型，但該法不能用于沒有產生新酶切位點的基因突變檢測。再次，以上這些方法都存在著檢測通量的局限性，每次只能檢測一種突變類型，不能滿足實際應用的需要。

發明內容

本發明的目的之一是提供STK11基因突變檢測液相芯片。該液相芯片可用于單獨或并行檢測STK11基因十種常見基因型C109T、169delG、180delC、G196A、C508T、G511A、C842T、837delC、C910T和G996A的野生型和突變型。

實現上述目的的技術方案如下：

一種STK11基因突變檢測液相芯片，包括有：

(A).針對STK11基因不同突變位點分別設計的野生型和突變型的ASPE引物：每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為：針對C109T位點的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22；針對169delG位點的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24；針對180delC位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26；針對G196A位點的SEQID?NO.27及SEQ?ID?NO.28；針對C508T位點的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30；針對G511A位點的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32；針對C842T位點的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34；針對837delC位點的SEQ?ID?NO.35及SEQ?ID?NO.36；針對C910T位點的SEQ?ID?NO.37及SEQ?IDNO.38；和/或針對G996A位點的SEQ?ID?NO.39及SEQ?ID?NO.40；所述tag序列選自SEQ?IDNO.1～SEQ?ID?NO.20；

(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.41～SEQ?ID?NO.60，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；

(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應突變位點的目標序列的引物。

優選地，所述擴增引物為針對C109T、169delG、180delC或G196A位點的SEQ?ID?NO.61及SEQ?ID?NO.62；針對C508T或G511A位點的SEQ?ID?NO.63及SEQ?ID?NO.64；針對C842T或837delC位點的SEQ?ID?NO.65及SEQ?ID?NO.66；針對C910T位點的SEQ?ID?NO.67及SEQID?NO.68；和/或針對G996A位點的SEQ?ID?NO.69及SEQ?ID?NO.70。