[發明專利]一種利用DNA甲基化的方法檢測苯丙酮尿癥的試劑盒無效
| 申請號: | 201110268599.3 | 申請日: | 2011-09-13 |
| 公開(公告)號: | CN102304583A | 公開(公告)日: | 2012-01-04 |
| 發明(設計)人: | 林明;周柔麗;楊華;李莉;邵根澤;肖軍軍 | 申請(專利權)人: | 北京大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/113 |
| 代理公司: | 北京眾合誠成知識產權代理有限公司 11246 | 代理人: | 史雙元 |
| 地址: | 100871*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 利用 dna 甲基化 方法 檢測 丙酮 試劑盒 | ||
1.一種利用DNA甲基化的方法檢測苯丙酮尿癥的試劑盒,包括dNTP、10xPCR?buffer、MgCl2、ddH2O、Taq?DNA聚合酶,其特征在于,還包括標準血液DNA、引物MSP-R、引物MSP-L、引物UMSP-R、引物UMSP-L、引物BSP-R1、引物BSP-L1、引物BSP-R2、引物BSP-L2;所述引物MSP-R的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.1所示,引物MSP-L的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.2所示,引物UMSP-R的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.3所示,引物UMSP-L的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.4所示,引物BSP-R1的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.5所示,引物BSP-L1的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.6所示,引物BSP-L2的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.7所示,引物BSP-R2的核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.8所示;上述引物用于做甲基化特異性PCR,PCR時,引物的配對方案為:
引物MSP-R、MSP-L配對,引物UMSP-R、UMSP-L配對,引物BSP-R1、BSP-L1配對,引物BSP-R2、BSP-L2配對,用于檢測ASS基因(GeneBankNG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)啟動子區甲基化情況。
2.根據權利要求1所述一種利用DNA甲基化的方法檢測苯丙酮尿癥的試劑盒,其特征在于,所述標準血液DNA為取自無苯丙酮尿癥健康人血液提取的基因組DNA并經過重亞硫酸鹽處理。
3.一種利用DNA甲基化的方法檢測苯丙酮尿癥的標志物,其特征在于,所述標志物為ASS基因(GeneBank?NG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)甲基化的啟動子區域,該區域包括一個或多個甲基化的CpG島;所述ASS(GeneBankNG_011542,精氨酸代琥珀酸合成酶基因)基因甲基化的啟動子區域核苷酸序列如序列表中SEQ?ID?No.9、SEQ?ID?No.10和SEQ?ID?No.11所示。
4.權利要求1所述利用DNA甲基化的方法檢測苯丙酮尿癥的試劑盒的使用方法,其特征在于,包括如下步驟:
(1)從血液樣品中提取基因組DNA;
(2)將基因組DNA經重亞硫酸鹽處理,使未甲基化的胞嘧啶全部轉變為尿嘧啶;
(3)利用權利要求1所述試劑盒及引物配對方案,以ddH2O、標準血液DNA、經重亞硫酸鹽處理的血液樣品基因組DNA為模板,進行甲基化特異性PCR反應;
(4)用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR結果,如果以ddH2O、標準血液DNA為模板的PCR無擴增條帶,而以經重亞硫酸鹽處理的血液樣品基因組DNA為模板的PCR擴增有擴增條帶,且擴增條帶與預測的條帶大小一致,則認為所檢測的血液樣品來自苯丙酮尿癥患者。
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