[發明專利]腫瘤癌變細胞FISH基因狀態自動檢測方法

有效

• 申請號: 201110173077.5
• 申請日: 2011-06-24
• 公開（公告）號: CN102270307A
• 公開（公告）日: 2011-12-07
• 發明（設計）人: 劉秉瀚;王偉智
• 申請（專利權）人: 福州大學
• 主分類號: G06K9/66
• 分類號: G06K9/66;C12Q1/68
• 代理公司: 福州元創專利商標代理有限公司 35100
• 代理人: 蔡學俊

1.一種腫瘤癌變細胞FISH基因狀態自動檢測方法，其特征在于：該方法在進行級聯結構訓練和協同模式訓練的基礎上，對基因狀態進行辨識；

所述級聯結構訓練按如下步驟進行：

首先，選擇基因狀態評估結果分別為高擴增、低擴增、無擴增的各種腫瘤FISH片，采集各類典型的基因信號的圖像作為訓練圖集，并將所述基因狀態評估結果作為訓練的類別信息；從所述訓練圖集中分別裁剪一批正例樣本和反例樣本構成正例樣本集和反例樣本集，所述正例樣本包括合格細胞子窗口和不合格細胞子窗口兩個類別，所述反例樣本為非細胞子窗口，對所述正例樣本集和反例樣本集分別進行顏色轉換；然后，迭代訓練基于Haar型特征的AdaBoost級聯結構，得到能表征細胞特性的Haar型特征組及AdaBoost級聯結構細胞檢測器；

所述協同模式訓練過程按如下步驟進行：

將正例樣本集作為訓練樣本集，進行原型選擇算法、序參量構造法及注意參數設置機制的訓練學習，依據敏感度、特異性、準確率的評估準則進行效果分析，不斷優化調整相關算法權重參數，得到協同模式細胞分類器；

所述基因狀態辨識過程按如下步驟進行：

步驟1：對待處理的腫瘤多視野FISH圖集中的圖像進行顏色轉換，然后送入所述級聯結構細胞檢測器進行子窗口篩選檢測；

步驟2：若檢測到的為細胞子窗口，送入所述協同模式細胞分類器進行識別，并轉步驟3；否則繼續檢測下一個子窗口；

步驟3：對識別為合格的細胞子窗口進行彩色圖像分割處理，檢測并統計出細胞內紅色與綠色信號點數量，依據紅色與綠色信號點數量的比值將細胞分類，同時獲取相關形態屬性特征參數；否則返回繼續檢測下一個子窗口，直至處理完一副圖像的所有子窗口；

步驟4：重復步驟1、2、3，直至腫瘤多視野FISH圖集中的所有圖像處理完畢之后，根據該病例檢測統計結果進行基因狀態擴增結果評估，并將各種形態屬性特征參數入庫保存。