[發明專利]物種移動鑒別系統、終端、服務器及方法有效
| 申請號: | 201110136064.0 | 申請日: | 2011-05-25 |
| 公開(公告)號: | CN102799795A | 公開(公告)日: | 2012-11-28 |
| 發明(設計)人: | 劉昶;李歡;陳士林;邢航;梁棟 | 申請(專利權)人: | 中國醫學科學院藥用植物研究所;北京航空航天大學 |
| 主分類號: | G06F19/16 | 分類號: | G06F19/16;G06F19/18;G06K7/10 |
| 代理公司: | 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038 | 代理人: | 顏鏑 |
| 地址: | 100193 北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 物種 移動 鑒別 系統 終端 服務器 方法 | ||
1.一種物種移動鑒別系統,包括:
通信終端,用于通過攝像/掃描功能采集被鑒定對象的二維碼圖像,并向網絡側發送物種鑒定請求,所述物種鑒定請求中攜帶所述二維碼圖像;
物種鑒定服務器,包括物種數據庫,用于接收所述通信終端發送的所述物種鑒定請求,并對所述物種鑒定請求中攜帶的二維碼圖像進行解碼,獲得對應的堿基序列,然后根據獲得的堿基序列在所述物種數據庫進行匹配,并根據匹配物種的信息組裝鑒定結論,將所述鑒定結論反饋給所述通信終端。
2.一種物種鑒定服務器,設于網絡側,包括:
鑒定請求接收模塊,用于接收通信終端發送的物種鑒定請求,所述物種鑒定請求中攜帶有所述通信終端通過攝像/掃描功能采集到的被鑒定對象的二維碼圖像;
二維碼圖像解碼模塊,用于對所述二維碼圖像進行解碼,獲得對應的堿基序列;
物種數據庫,用于保存各個物種的參考堿基序列;
堿基序列匹配模塊,用于根據獲得的堿基序列在所述物種數據庫進行匹配;
鑒定結論組裝模塊,用于根據匹配物種的信息組裝鑒定結論;
鑒定結論反饋模塊,用于將所述鑒定結論反饋給所述通信終端。
3.根據權利要求2所述的物種鑒定服務器,其中所述二維碼圖像解碼模塊具體包括:
Qrcode解碼單元,用于采用標準Qrcode算法對所述二維碼圖像進行解碼,得到對應的十進制數字串;
動態解碼單元,用于判斷所述十進制數字串采用的編碼方式,如果是定長編碼方式,則采用定長解碼方式對所述十進制數字串進行解碼,得到對應的堿基序列;如果是哈夫曼編碼方式,則采用哈夫曼解碼方式對所述十進制數字串進行解碼,得到對應的堿基序列。
4.一種物種移動鑒別方法,包括:
網絡側的物種鑒定服務器接收通信終端發送的物種鑒定請求,所述物種鑒定請求中攜帶有所述通信終端通過攝像/掃描功能采集到的被鑒定對象的二維碼圖像;
所述物種鑒定服務器對所述二維碼圖像進行解碼,獲得對應的堿基序列;
所述物種鑒定服務器根據獲得的堿基序列在物種數據庫進行匹配,并根據匹配物種的信息組裝鑒定結論;
所述物種鑒定服務器將所述鑒定結論反饋給所述通信終端。
5.根據權利要求4所述的物種移動鑒別方法,其中還包括所述物種數據庫的建立流程,具體包括:
導入公共數據庫中的堿基序列文件;
解析所述堿基序列文件,得到所有的DNA條形碼的序列;
對所述DNA條形碼的序列進行預處理,并將預處理后得到的序列存入物種數據庫;
按照預設物種對已存入所述物種數據庫中的序列進行分類;
分別對每個物種進行判斷,判斷該物種是否只對應一條序列,是則將該序列設為該物種的參考堿基序列,否則采用Phrap方法將該物種對應的多條堿基序列組裝成一條一致序列;
判斷組裝后的堿基序列中是否只包括一個一致序列,是則將該一致序列設為該物種的參考堿基序列,否則將所述組裝后的堿基序列所包括的多個一致序列中的每個一致序列均作為該物種的參考堿基序列;
在所述物種數據庫中保存每個物種的參考堿基序列。
6.根據權利要求5所述的物種移動鑒別方法,其中所述對DNA條形碼的序列進行預處理的操作具體為:
去除所述DNA條形碼的序列兩端的非核心序列,將屬于同一物種的不同個體的DNA條形碼的序列進行拼接,生成表示該物種DNA條形碼序列的一致序列。
7.根據權利要求4所述的物種移動鑒別方法,其中所述物種鑒定服務器對所述二維碼圖像進行解碼,獲得對應的堿基序列的操作具體為:
所述物種鑒定服務器采用標準QR?code算法對所述二維碼圖像進行解碼,得到對應的十進制數字串;
判斷所述十進制數字串采用的編碼方式,如果是定長編碼方式,則采用定長解碼方式對所述十進制數字串進行解碼,得到對應的堿基序列;如果是哈夫曼編碼方式,則采用哈夫曼解碼方式對所述十進制數字串進行解碼,得到對應的堿基序列。
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G06F 電數字數據處理
G06F19-00 專門適用于特定應用的數字計算或數據處理的設備或方法
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G06F19-12 ..用于系統生物學的建模或仿真,例如:概率模型或動態模型,遺傳基因管理網絡,蛋白質交互作用網絡或新陳代謝作用網絡
G06F19-14 ..用于發展或進化的,例如:進化的保存區域決定或進化樹結構
G06F19-16 ..用于分子結構的,例如:結構排序,結構或功能關系,蛋白質折疊,結構域拓撲,用結構數據的藥靶,涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的,例如:基因型–表型關聯,不均衡連接,種群遺傳學,結合位置鑒定,變異發生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用





