[發明專利]一種LncRNA與mRNA關聯分析的方法無效
| 申請號： | 201110135546.4 | 申請日： | 2011-05-24 |
| 公開（公告）號： | CN102799796A | 公開（公告）日： | 2012-11-28 |
| 發明（設計）人： | 曾華宗 | 申請（專利權）人： | 上海聚類生物科技有限公司 |
| 主分類號： | G06F19/20 | 分類號： | G06F19/20;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 200333 上海市*** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 lncrna mrna 關聯 分析 方法 | ||
【權利要求書】：
1.本發明通過LncRNA與其靶基因的網絡構建，找到了一種網絡構建的方法，將芯片檢測產生的LncRNA數據和mRNA數據進行關聯分析。可以更深入的挖掘lncRNA的生物學意義，其基本流程如下：
步驟一：對LncRNA芯片檢測所獲得的數據進行數據預處理及均一化。
步驟二：篩選差異表達的LncRNA。
步驟三：篩選差異表達的mRNA。
步驟三：針對差異表達的lncRNA預測其cis作用方式的靶基因。
步驟四：針對差異表達的lncRNA預測其trans作用方式的靶基因。
步驟五：整理長鏈非編碼RNA的信息和靶基因(差異表達的mRNA)之間的關系進行網絡構建。
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G06 計算；推算；計數
G06F 電數字數據處理
G06F19-00 專門適用于特定應用的數字計算或數據處理的設備或方法
G06F19-10 .生物信息學，即計算分子生物學中的遺傳或蛋白質相關的數據處理方法或系統
G06F19-12 ..用于系統生物學的建模或仿真，例如：概率模型或動態模型，遺傳基因管理網絡，蛋白質交互作用網絡或新陳代謝作用網絡
G06F19-14 ..用于發展或進化的，例如：進化的保存區域決定或進化樹結構
G06F19-16 ..用于分子結構的，例如：結構排序，結構或功能關系，蛋白質折疊，結構域拓撲，用結構數據的藥靶，涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的，例如：基因型–表型關聯，不均衡連接，種群遺傳學，結合位置鑒定，變異發生，基因型或染色體組的注釋，蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用
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