[發明專利]與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記SIsv0690

有效

• 申請號: 201110072615.1
• 申請日: 2011-03-24
• 公開（公告）號: CN102690810A
• 公開（公告）日: 2012-09-26
• 發明（設計）人: 張耕耘;全志武;夏秋菊;張厚寶
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12N15/63;C12N5/10;C12Q1/68
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技術領域

本發明屬于分子生物學領域，涉及一種分子標記，特別是涉及一種與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記。本發明還涉及擴增該分子標記的引物、該分子標記和引物在谷子葉片顏色基因定位或谷子遺傳育種中的用途。

背景技術

我國是谷子(Setaria?italica?L.Beauv.)的原產國，是世界上谷子的集中種植國，谷子在我國的國民經濟和社會生產中占有重要的地位，對旱作生態農業建設有重要意義。因此，加速谷子的育種進程尤為重要。由于谷子只是區域重要性作物，因此當前有關谷子的研究手段和方法相對較落后，如何應用先進科學的研究手段搞好谷子育種是一個嚴峻的問題。隨著分子生物學的發展，分子標記技術的出現，為谷子的遺傳研究及育種開辟了新的思路和手段。開發具有我國特色的重要性狀基因的分子標記并進行輔助選擇育種研究，將對提高我國谷子育種水平起到促進作用。

植物葉色是葉綠體中各種色素的綜合表現，正常葉片中葉綠素占優勢，通常表現為綠色。葉色變異是高等植物中突變頻率較高且易于鑒定的突變性狀。迄今為止，在水稻、小麥、大麥、玉米、大豆、棉花、煙草、玉米、向日葵、番茄、黃瓜、馬鈴薯、桑樹等幾乎所有高等植物中都發現了葉色突變體。其突變基因直接或間接影響光合色素，特別是葉綠素的合成和降解，導致各種色素的含量和比例改變，從而引起植物葉色變異。近年來，葉色突變體的利用價值越來越受到關注，現已成為研究植物光合作用機制、葉綠素生物合成途徑、葉綠體的發育和遺傳控制機理的特殊材料，同時葉色突變體在高光效育種和標記性狀的利用上也具有重要的應用價值。一些葉色變異被作為標記性狀用于良種繁育和雜交種生產。隨著擬南芥、水稻等模式植物基因組測序的完成，葉色突變體在功能基因組學上的研究價值受到越來越多的關注，它們已成為研究光合系統結構、基因功能及其調控機制的理想材料。據不完全統計，目前報道的水稻葉色突變的相關基因已經超過80個，這些突變體大致可分為白化型、黃化型、條紋型、轉綠型、斑馬葉等5大類。但對于谷子葉色基因以及與之緊密連鎖的分子標記的研究基本沒有文獻報道。

發明內容

本發明的目的是提供一種與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記。

本發明的另一目的是提供一種可用于PCR擴增與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記的引物對，以及由該引物對擴增獲得的分子標記。

本發明的再一目的是提供上述分子標記在谷子葉片顏色基因定位、檢測以及谷子輔助育種中的用途以及上述分子標記的檢測方法。

本發明的目的還包括提供一種包括上述分子標記的重組載體，以及含有該重組載體的重組細胞；提供一種包括使用上述分子標記的谷子葉片顏色基因的定位方法，和使用所述分子標記的谷子輔助育種方法。

為了實現上述目的，本發明采用了以下技術方案：

本發明公開了一種與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記，所述分子標記含有Seq?ID?No.1所示序列；優選的所述分子標記具有Seq?ID?No.1所示序列。

本發明還公開了一種擴增與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記的引物對，所述引物對的引物1含有Seq?ID?No.2所示序列，引物2含有Seq?ID?No.3所示序列；優選的所述引物1具有Seq?ID?No.2所示序列，引物2具有Seq?ID?No.3所示序列；

Seq?ID?No.2：5’-CAATTACACTCTAGTCTTGCC-3’；

Seq?ID?No.3：5’-TGCACAAAGACCCTTACGTT-3’。

本發明還公開了一種與谷子葉片顏色基因緊密連鎖的分子標記，所述分子標記是由上述的引物對以葉片偏綠色的谷子基因組DNA為模板經PCR擴增得到的。

優選的由上述引物對擴增得到的分子標記含有Seq?ID?No.1所示序列。