[發明專利]用于評定細胞中的基因轉錄水平的寡核苷酸探針

無效

• 申請號: 201110063228.1
• 申請日: 2003-11-21
• 公開（公告）號: CN102191319A
• 公開（公告）日: 2011-09-21
• 發明（設計）人: 普拉維恩.沙馬;納林德.S.薩尼;安德斯.朗尼伯格
• 申請（專利權）人: 迪亞吉尼克公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11;C07K14/435;C07K16/18
• 代理公司: 北京市柳沈律師事務所 11105
• 代理人: 閔丹

1.一組寡核苷酸探針，其中所述組包括至少10種選自如下的寡核苷酸：表1中描述的寡核苷酸或來源于表1描述的序列的寡核苷酸，或具有互補序列的寡核苷酸，或功能性等價的寡核苷酸。

2.權利要求1中要求保護的一組寡核苷酸探針，其中所述寡核苷酸探針選自：在表2中描述的寡核苷酸或來源于在表2描述的序列的寡核苷酸，或具有互補序列的寡核苷酸，或功能性等價的寡核苷酸。

3.權利要求1中要求保護的一組寡核苷酸探針，其中所述寡核苷酸探針選自：表4中描述的寡核苷酸或來源于在表4描述的序列的寡核苷酸，或具有互補序列的寡核苷酸，或功能性等價的寡核苷酸。

4.權利要求1-3的任何一項中要求保護的一組寡核苷酸探針，其中所述組中的各種探針結合到不同轉錄物上。

5.權利要求1-4的任何一項中要求保護的探針組，由10-500種寡核苷酸探針組成。

6.一種寡核苷酸探針，其中所述探針選自列舉在表1中的寡核苷酸，或來源于在表1中描述的序列的寡核苷酸，或其互補序列。

7.權利要求1-5的任何一項中要求保護的一組寡核苷酸探針或權利要求6中要求保護的寡核苷酸探針，其中各種所述寡核苷酸探針長度為15-200個堿基。

8.權利要求1-5或7的任何一項中要求保護的一組寡核苷酸探針或權利要求6或7中要求保護的寡核苷酸探針，其中所述探針結合的轉錄物來源于被組成型地中度或高度表達的基因。

9.權利要求1-5、7或8的任何一項中要求保護的一組寡核苷酸探針或權利要求6-8中要求保護的寡核苷酸探針，其中所述探針被固定在一種或多種固體支持物上。

10.權利要求9要求保護的一組寡核苷酸探針或寡核苷酸探針，其中所述固體支持物是片、濾器、膜、平板或生物芯片。

11.由權利要求6中定義的寡核苷酸結合的mRNA序列編碼的多肽。

12.權利要求11中定義的多肽的抗體。

13.包括固定在一種或多種在權利要求9或10中定義的固體支持物上的一組寡核苷酸探針的試劑盒。

14.權利要求13要求保護的試劑盒，其中所述探針被固定在單一的固體支持物上，各種獨有的探針被附著到所述固體支持物的不同區域上。

15.如權利要求13或14要求保護的試劑盒，還包括進行標準化的物質。

16.權利要求1-5或7的任何一項所述的一組探針或者權利要求13-15中所述的試劑盒在確定細胞的基因表達模式中的用途，該模式反映所述寡核苷酸探針結合的基因的基因表達水平，其至少包括步驟：

a)從所述細胞中分離mRNA，可選擇地將mRNA反轉錄為cDNA；

b)將步驟(a)的mRNA或cDNA雜交到權利要求1-5、7-10或13-15的任何一項定義的一組寡核苷酸或試劑盒上；和

c)評價雜交到所述探針上的mRNA或cDNA的含量，以生成所述模式。

17.一種制備標準基因轉錄模式的方法，該標準基因轉錄模式是生物體的疾病或病癥或其階段特征性的，該方法至少包括步驟：

a)從所述一種或多種患有疾病或病癥或其階段的生物體的樣本的細胞中分離mRNA，可選擇地將mRNA反轉錄為cDNA；

b)將步驟(a)的mRNA或cDNA雜交到特異于所述生物體及其樣本的疾病或病癥或其階段的權利要求1-5、7-10或13-15的任何一項定義的一組寡核苷酸或試劑盒上，該生物體和樣本對應于被研究的生物體及其樣本；和

c)評價雜交到各種所述探針上的mRNA或cDNA的量，以生成特征性模式，該模式反映患有疾病、病癥或其階段的樣本中，所述寡核苷酸結合的基因的基因表達水平。