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[發(fā)明專利]豬傳染性胃腸炎多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法無(wú)效

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 201110008010.6 申請(qǐng)日: 2011-01-14
公開(公告)號(hào): CN102586409A 公開(公告)日: 2012-07-18
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 鄭世民;趙良友;劉超男;高雪麗;呂曉萍 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 鄭世民
主分類號(hào): C12Q1/68 分類號(hào): C12Q1/68
代理公司: 哈爾濱東方專利事務(wù)所 23118 代理人: 陳曉光
地址: 150030 黑龍*** 國(guó)省代碼: 黑龍江;23
權(quán)利要求書: 查看更多 說(shuō)明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 傳染性 胃腸炎 多重 轉(zhuǎn)錄 聚合 鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 檢測(cè) 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種豬傳染性胃腸炎多重的反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法,其特征是:所述的方法有八步,分別為豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV基因引物設(shè)計(jì)與合成、豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR診斷方法的建立、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物濃度優(yōu)化、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR氯化鎂MgCl2濃度優(yōu)化、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR三磷酸堿基脫氧核苷酸dNTP濃度優(yōu)化、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR最佳退火溫度的確定、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR敏感性試驗(yàn)、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR特異性試驗(yàn)。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的豬傳染性胃腸炎多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法,其特征是:所述的引物設(shè)計(jì)與合成;根據(jù)基因庫(kù)GenBank上已發(fā)表的豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV的纖突蛋白S蛋白基因序列,比較分析保守序列,按反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR和多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物設(shè)計(jì)原則,通過(guò)歐立格Oligo6.0及普來(lái)模Primer5.0軟件設(shè)計(jì)豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV基因引物;所述的?豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR反應(yīng)體系:?建立如下二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR反應(yīng)體系,總體積為25μL:

超純水(ddH20)??????????????????????????????????????7.87μl

緩沖液(10×PCR?Buffer)?????????????????????????????5.0μl

三磷酸堿基脫氧核苷酸[dNTP?Mixture(2.5mmol/L)]????????4.0μl

P3(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl

P4(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl

P5(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl

P6(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl

豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)互補(bǔ)脫氧核糖核酸(cDNA)?????2.0μl

豬流行性腹瀉病毒(PEDV)互補(bǔ)脫氧核糖核酸(cDNA)???????2.0μl

氯化鎂[MgCl2?(25mmol/L)?]?????????????????????????????2.0μl

聚合酶[rTaq?(5U/μl)]????????????????????????????????0.13μl

將二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR產(chǎn)物及陰性對(duì)照產(chǎn)物同脫氧核糖核酸分子量標(biāo)記物DL2000于1%瓊脂糖凝膠電泳,經(jīng)紫外檢測(cè)儀檢測(cè)并拍照;可以看出陰性對(duì)照無(wú)電泳帶;PEDV和TGEV混合cDNA中在500bp上下有兩條電泳帶,大小分別約為584bp和426bp,分別為PEDV和TGEV的特異片段電泳帶;TGEVcDNA中有一條大小約為426bp電泳帶,為TGEV的特異片段電泳帶;PEDVcDNA中有一條大小約為584bp電泳帶,為PEDV的特異片段電泳帶。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的豬傳染性胃腸炎多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法,其特征是:所述的二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物濃度優(yōu)化;試驗(yàn)確定的豬傳染性胃腸炎病毒TGEV模板稀釋度,加入豬流行性腹瀉病毒PEDV滴定的引物濃度最佳量及不同濃度的豬傳染性胃腸炎病毒TGEV引物進(jìn)行二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物優(yōu)化;?引物濃度從8μmo1/L~10μmo1/L電泳帶均較亮,相比之下引物濃度在8μmo1/L時(shí),目的片段條帶最為清晰,且完整性好,說(shuō)明其擴(kuò)增效好。

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