[發(fā)明專利]豬傳染性胃腸炎多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201110008010.6 | 申請(qǐng)日: | 2011-01-14 |
| 公開(公告)號(hào): | CN102586409A | 公開(公告)日: | 2012-07-18 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 鄭世民;趙良友;劉超男;高雪麗;呂曉萍 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 鄭世民 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 哈爾濱東方專利事務(wù)所 23118 | 代理人: | 陳曉光 |
| 地址: | 150030 黑龍*** | 國(guó)省代碼: | 黑龍江;23 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說(shuō)明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 傳染性 胃腸炎 多重 轉(zhuǎn)錄 聚合 鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 檢測(cè) 方法 | ||
1.一種豬傳染性胃腸炎多重的反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法,其特征是:所述的方法有八步,分別為豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV基因引物設(shè)計(jì)與合成、豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR診斷方法的建立、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物濃度優(yōu)化、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR氯化鎂MgCl2濃度優(yōu)化、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR三磷酸堿基脫氧核苷酸dNTP濃度優(yōu)化、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR最佳退火溫度的確定、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR敏感性試驗(yàn)、二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR特異性試驗(yàn)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的豬傳染性胃腸炎多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法,其特征是:所述的引物設(shè)計(jì)與合成;根據(jù)基因庫(kù)GenBank上已發(fā)表的豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV的纖突蛋白S蛋白基因序列,比較分析保守序列,按反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR和多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物設(shè)計(jì)原則,通過(guò)歐立格Oligo6.0及普來(lái)模Primer5.0軟件設(shè)計(jì)豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV基因引物;所述的?豬傳染性胃腸炎病毒TGEV和豬流行性腹瀉病毒PEDV二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR反應(yīng)體系:?建立如下二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR反應(yīng)體系,總體積為25μL:
超純水(ddH20)??????????????????????????????????????7.87μl
緩沖液(10×PCR?Buffer)?????????????????????????????5.0μl
三磷酸堿基脫氧核苷酸[dNTP?Mixture(2.5mmol/L)]????????4.0μl
P3(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl
P4(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl
P5(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl
P6(10μmol/L)???????????????????????????????????????0.5μl
豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)互補(bǔ)脫氧核糖核酸(cDNA)?????2.0μl
豬流行性腹瀉病毒(PEDV)互補(bǔ)脫氧核糖核酸(cDNA)???????2.0μl
氯化鎂[MgCl2?(25mmol/L)?]?????????????????????????????2.0μl
聚合酶[rTaq?(5U/μl)]????????????????????????????????0.13μl
將二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR產(chǎn)物及陰性對(duì)照產(chǎn)物同脫氧核糖核酸分子量標(biāo)記物DL2000于1%瓊脂糖凝膠電泳,經(jīng)紫外檢測(cè)儀檢測(cè)并拍照;可以看出陰性對(duì)照無(wú)電泳帶;PEDV和TGEV混合cDNA中在500bp上下有兩條電泳帶,大小分別約為584bp和426bp,分別為PEDV和TGEV的特異片段電泳帶;TGEVcDNA中有一條大小約為426bp電泳帶,為TGEV的特異片段電泳帶;PEDVcDNA中有一條大小約為584bp電泳帶,為PEDV的特異片段電泳帶。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的豬傳染性胃腸炎多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)方法,其特征是:所述的二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物濃度優(yōu)化;試驗(yàn)確定的豬傳染性胃腸炎病毒TGEV模板稀釋度,加入豬流行性腹瀉病毒PEDV滴定的引物濃度最佳量及不同濃度的豬傳染性胃腸炎病毒TGEV引物進(jìn)行二聯(lián)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR引物優(yōu)化;?引物濃度從8μmo1/L~10μmo1/L電泳帶均較亮,相比之下引物濃度在8μmo1/L時(shí),目的片段條帶最為清晰,且完整性好,說(shuō)明其擴(kuò)增效好。
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