[發明專利]通過展開進行高通量核酸測序和相關方法

無效

• 申請號: 201080014202.1
• 申請日: 2010-01-29
• 公開（公告）號: CN102365367A
• 公開（公告）日: 2012-02-29
• 發明（設計）人: 馬克·斯達馬蒂奧斯·可可里斯;羅伯特·N·麥克盧爾
• 申請（專利權）人: 斯特拉托斯基因公司
• 主分類號: C12P19/34
• 分類號: C12P19/34;G01N33/48
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204
• 代理人: 王達佐;洪欣

1.用于靶核酸測序的方法，包括：

a)提供通過模板指導合成所產生的S-X子鏈，所述子鏈包含偶聯 于序列中的多個亞基，所述序列對應于全部或部分所述靶核酸的連續 核苷酸序列，其中個體亞基包含連接臂、至少一個探針以及至少一個 可選擇性切割的鍵，所述至少一個探針包含X個核堿基殘基(X是大于 1的正整數)和編碼所述探針的Y個核堿基殘基的遺傳信息的至少一個 報道構建體(Y是小于X的正整數)；

b)切割所述至少一個可選擇性切割的鍵，以產生長度比所述S-X 子鏈的多個亞基長的S-Xpandomer，所述S-Xpandomer包含所述連接 臂和用于確定每X個核堿基中的Y個核堿基的報道元件；以及

c)檢測所述至少一個報道構建體，以使所述子鏈的每X個核堿基中 的Y個核堿基的遺傳信息解碼。

2.如權利要求1所述的方法，其中所述靶核酸通過模板指導滾環 聚合方法產生。

3.如權利要求1所述的方法，其中所述模板指導合成包括連接反 應。

4.如權利要求3所述的方法，其中所述連接反應是酶促連接反應。

5.如權利要求1所述的方法，其中所述至少一個報道構建體與以 下相連：

所述S-Xpandomer的連接臂；

在所述至少一個可選擇性切割的鍵切割前的S-X子鏈；或

在所述至少一個可選擇性切割的鍵切割后的S-Xpandomer。

6.如權利要求1所述的方法，其中所述至少一個報道構建體在所 述S-X子鏈模板指導合成后，連接于所述S-X子鏈。

7.如權利要求1所述的方法，其中所述連接臂在所述S-X子鏈模 板指導合成后，連接于所述S-X子鏈。

8.如權利要求1所述的方法，其中所述S-Xpandomer還包含所述 至少一個探針的全部或部分。

9.如權利要求8所述的方法，其中所述至少一個報道構建體是所 述至少一個探針或與所述至少一個探針相連。

10.如權利要求1所述的方法，其中所述至少一個可選擇性切割 的鍵是：

共價鍵；

連接臂內的鍵；

所述S-X子鏈的探針或核堿基殘基之間或之內的鍵；或

所述S-X子鏈的探針或核堿基殘基和靶模板之間的鍵。