[發明專利]一種KCNQ1、KCNE2與KCNN3基因SNP檢測特異性引物和液相芯片

有效

• 申請號: 201010590687.0
• 申請日: 2010-12-16
• 公開（公告）號: CN102533947A
• 公開（公告）日: 2012-07-04
• 發明（設計）人: 許嘉森;秦會娟;陳少賢;劉志明
• 申請（專利權）人: 廣州益善生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 萬志香;胡杰

1.一種KCNQ1、KCNE2與KCNN3基因SNP檢測液相芯片，其特征在于：主要包括有：

(A).針對每種SNP分別設計的野生型和突變型的ASPE引物：每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因SNP位點的特異性引物組成，所述野生型和突變型的特異性引物分別為：針對KCNQ1基因A184G?SNP位點的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10、針對KCNQ1基因A70C?SNP位點的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12、針對KCNE2基因G166A?SNP位點的SEQ?IDNO.13及SEQ?ID?NO.14、和/或針對KCNN3基因G107A?SNP位點的SEQ?ID?NO.15及SEQ?IDNO.16；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1～8；

(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.17～SEQ?ID?NO.24中的序列，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；

(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應SNP位點的目標序列的引物。

2.根據權利要求1所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP檢測液相芯片，其特征在于，所述擴增引物為：針對KCNQ1基因A184G?SNP位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26、針對KCNQ1基因A70C?SNP位點的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28、針對KCNE2基因G166ASNP位點的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30、和/或針對KCNN3基因G107A?SNP位點的SEQ?IDNO.31及SEQ?ID?NO.32。

3.根據權利要求1所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP檢測液相芯片，其特征在于，所述ASPE引物為：由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.9組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?IDNO.10組成的序列、由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.11組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?IDNO.12組成的序列、由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.13組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?IDNO.14組成的序列、和/或由SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.15組成的序列及由SEQ?ID?NO.8和SEQID?NO.16組成的序列。

4.根據權利要求1所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP檢測液相芯片，其特征在于，

(A).所述ASPE引物為：由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.9組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.10組成的序列、由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.11組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.12組成的序列、由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.13組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.14組成的序列、和由SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.15組成的序列及由SEQ?ID?NO.8和SEQ?ID?NO.16組成的序列；

(B).由anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.17～SEQ?ID?NO.24中的序列，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；

(C).所述擴增引物為：針對KCNQ1基因A184G?SNP位點的SEQ?ID?NO.25及SEQ?IDNO.26、針對KCNQ1基因A70C?SNP位點的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28、針對KCNE2基因G166A?SNP位點的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30、和針對KCNN3基因G107A?SNP位點的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32。

5.根據權利要求1-4任一項所述的KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP檢測液相芯片，其特征在于，所述間隔臂為5-10個T。

6.一種用于KCNQ1、KCNE2和KCNN3基因SNP檢測的特異性引物，其特征在于，包括有：針對KCNQ1基因A184G?SNP位點的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10、針對KCNQ1基因A70C?SNP位點的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12、針對KCNE2基因G166A?SNP位點的SEQ?IDNO.13及SEQ?ID?NO.14、和/或針對KCNN3基因G107A?SNP位點的SEQ?ID?NO.15及SEQ?IDNO.16。