[發(fā)明專利]一種c-KIT基因突變檢測(cè)液相芯片

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201010292616.2
• 申請(qǐng)日: 2010-09-21
• 公開（公告）號(hào): CN101984070A
• 公開（公告）日: 2011-03-09
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 許嘉森;余剛
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 廣州益善生物技術(shù)有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68
• 代理公司: 廣州華進(jìn)聯(lián)合專利商標(biāo)代理有限公司 44224
• 代理人: 萬志香;曾旻輝

1.一種c-KIT基因突變檢測(cè)液相芯片，其特征是，主要包括有：

(A)針對(duì)c-KIT基因的突變位點(diǎn)，分別設(shè)計(jì)的野生型和突變型的ASPE引物對(duì)：每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對(duì)突變位點(diǎn)的特異性引物組成，所述特異性引物是：針對(duì)AY502-503dup突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.10和SEQ?ID?NO.11、針對(duì)V560G突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.12和SEQ?ID?NO.13、針對(duì)T670I突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.14和SEQ?ID?NO.15、和/或針對(duì)D816H/V突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.16及SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.18；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.9；

(B)分別包被有特異的anti-tag序列的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.19～SEQ?ID?NO.27中的序列，所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(A)中所選的tag序列互補(bǔ)配對(duì)，且所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；

(C)用于擴(kuò)增具有AY502-503dup、V560G、T670I、和/或D816H/V的突變位點(diǎn)的c-KIT基因目標(biāo)序列的擴(kuò)增引物。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的c-KIT基因突變檢測(cè)液相芯片，其特征是，所述擴(kuò)增引物為：針對(duì)AY502-503dup和V560G突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.28和SEQ?ID?NO.29、針對(duì)T670I突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.30和SEQ?ID?NO.31、和/或針對(duì)D816H/V突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.32和SEQ?ID?NO.33。

3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的c-KIT基因突變檢測(cè)液相芯片，其特征是，

(A)ASPE引物對(duì)為：針對(duì)AY502-503dup突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.10組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.11組成的序列、針對(duì)V560G突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.12組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.13組成的序列、針對(duì)T670I突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.14組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.15組成的序列、和/或針對(duì)D816H/V突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.16組成的序列、由SEQ?ID?NO.8和SEQ?ID?NO.17組成的序列及由SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.18組成的序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的c-KIT基因突變檢測(cè)液相芯片，其特征是，

(A)ASPE引物對(duì)為：針對(duì)AY502-503dup突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.10組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.11組成的序列、針對(duì)V560G突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.12組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.13組成的序列、針對(duì)T670I突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.14組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.15組成的序列、和針對(duì)D816H/V突變位點(diǎn)的由SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.16組成的序列、由SEQ?ID?NO.8和SEQ?ID?NO.17組成的序列及由SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.18組成的序列；

(B)分別包被有特異的anti-tag序列的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.19～SEQ?ID?NO.27中的序列，所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(A)中所選的tag序列互補(bǔ)配對(duì)，且所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；

(C)所述擴(kuò)增引物為：針對(duì)AY502-503dup和V560G突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.28和SEQ?ID?NO.29、針對(duì)T670I突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.30和SEQ?ID?NO.31、和針對(duì)D816H/V突變位點(diǎn)的SEQ?ID?NO.32和SEQ?ID?NO.33。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的c-KIT基因突變檢測(cè)液相芯片，其特征是，所述間隔臂序列為5-10個(gè)T。