[發(fā)明專(zhuān)利]乳腺癌預(yù)后相關(guān)基因mRNA表達(dá)水平檢測(cè)液相芯片

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201010261745.5
• 申請(qǐng)日: 2010-08-23
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN101921858A
• 公開(kāi)（公告）日: 2010-12-22
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 許嘉森;吳詩(shī)楊;楊惠夷;何嘉英;郭元杰
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 廣州益善生物技術(shù)有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/68
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/68
• 代理公司: 廣州華進(jìn)聯(lián)合專(zhuān)利商標(biāo)代理有限公司 44224
• 代理人: 萬(wàn)志香;曾旻輝

1.一種乳腺癌預(yù)后相關(guān)基因mRNA表達(dá)水平檢測(cè)液相芯片，其特征是，主要包括有：

(1)針對(duì)不同目標(biāo)基因的、與胺基修飾的支持探針偶聯(lián)的微球，每條支持探針主要包括5’端的間隔臂序列和3’端的與支持延伸探針互補(bǔ)配對(duì)的特異性序列P1，所述支持探針包括有針對(duì)ESR1基因的SEQ.ID?NO.1和針對(duì)PGR基因的SEQ.ID?NO.2，每種微球具有不同的熒光編碼；

(2)連接支持探針與目標(biāo)基因mRNA的支持延伸探針，每條支持延伸探針主要包括5’端能與對(duì)應(yīng)的目標(biāo)基因mRNA結(jié)合的特異性序列P2、間隔臂序列、3’端能與對(duì)應(yīng)的支持探針的特異性序列P1互補(bǔ)配對(duì)的P3序列，所述支持延伸探針的特異性序列P2包括有：針對(duì)ESR1基因的選自SEQ.ID?NO.24-SEQ.ID?NO.28中的2條以上、和針對(duì)PGR基因的選自SEQ.ID?NO.29-SEQ.ID?NO.33中的2條以上；

(3)擴(kuò)增延伸探針，每條擴(kuò)增延伸探針包括有5’端能與目標(biāo)基因mRNA結(jié)合的特異性序列P4、間隔臂序列、3’端序列P5，3’端還修飾有生物素；所述擴(kuò)增延伸探針的特異性序列P4包括有：針對(duì)ESR1基因的選自SEQ.ID?NO.166-SEQ.ID?NO.175中的5條以上，和針對(duì)PGR基因的選自SEQ.ID?NO.176-SEQ.ID?NO.185中的5條以上；所述P5為不存在發(fā)夾結(jié)構(gòu)，探針內(nèi)部和探針間不形成二聚體、與P1、P2、P3、P4和總mRNA之間均不存在非特異性結(jié)合的序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的液相芯片，其特征是，所述支持探針還包括有以下5種基因中的1種以上：針對(duì)RPLPO基因的SEQ?ID?NO.3、針對(duì)GAPDH基因的SEQ?ID?NO.4、針對(duì)GUSB基因的SEQ?ID?NO.5、針對(duì)ACTB基因的SEQ?ID?NO.6和針對(duì)TFRC基因的SEQ?ID?NO.7；

相應(yīng)地，所述支持延伸探針的特異性序列P2還包括有以下5種基因中的1種以上：針對(duì)RPLPO基因的選自SEQ.ID?NO.34-SEQ.ID?NO.38中的2條以上、針對(duì)GAPDH基因的選自SEQ.ID?NO.39-SEQ.ID?NO.44中的2條以上、針對(duì)GUSB基因的SSEQ.ID?NO.45-SEQ.IDNO.49中的2條以上、針對(duì)ACTB基因的SEQ.ID?NO.50-SEQ.ID?NO.54中的2條以上和針對(duì)TFRC基因的SEQ.ID?NO.55-SEQ.ID?NO.59中的2條以上；

相應(yīng)地，所述擴(kuò)增延伸探針的特異性序列P4還包括有以下5種基因中的1種以上：針對(duì)RPLPO基因的選自SEQ.ID?NO.186-SEQ.ID?NO.195中的5條以上、針對(duì)GAPDH基因的選自SEQ.ID?NO.196-SEQ.ID?NO.206中的5條以上、針對(duì)GUSB基因的SSEQ.ID?NO.207-SEQ.ID?NO.216中的5條以上、針對(duì)ACTB基因的SEQ.ID?NO.217-SEQ.ID?NO.226中的5條以上和針對(duì)TFRC基因的SEQ.ID?NO.227-SEQ.ID?NO.237中的5條以上。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的液相芯片，其特征是，還包括有：填充序列，針對(duì)RPLPO基因的選自SEQ?ID?NO.412-SEQ?ID?NO.413中的1條以上、針對(duì)GAPDH基因的SEQ?ID?NO.414、針對(duì)GUSB基因的選自SEQ?ID?NO.415-SEQ?ID?NO.417中的1條以上、針對(duì)ACTB基因的選自SEQID?NO.418-SEQ?ID?NO.422中的1條以上。

4.根據(jù)權(quán)利要求1-3任一所述的液相芯片，其特征是，還包括有：填充序列，針對(duì)ESR1基因的選自SEQ?ID?NO.399-SEQ?ID?NO.403中的1條以上，針對(duì)PGR基因的選自SEQ?IDNO.406-SEQ?ID?NO.408中的1條以上。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的液相芯片，其特征是，所述P5的堿基組成為SEQ?ID?NO.398所示。