[發(fā)明專利]一種黃牛chemerin基因的單核苷酸多態(tài)性檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010255639.6 | 申請日: | 2010-08-18 |
| 公開(公告)號: | CN101921854A | 公開(公告)日: | 2010-12-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 陳宏;張亞;朱金龍;徐瑤;藍(lán)賢勇;雷初朝 | 申請(專利權(quán))人: | 西北農(nóng)林科技大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 712100 *** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 黃牛 chemerin 基因 核苷酸 多態(tài)性 檢測 方法 | ||
1.一種黃牛chemerin基因的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:
以包含黃牛chemerin基因的待測黃牛全基因組DNA為模板,以引物對P為引物,PCR擴(kuò)增黃牛chemerin基因;
所述的引物對P為:
正向引物:5’-CGGAGCCCACCAGACAGG-3’18bp;
反向引物:5’-CAGCGGGCAGCAGCACAC-3’18bp;
將PCR產(chǎn)物送測序,根據(jù)測序結(jié)果及突變情況,在第1021位之后重新設(shè)計下游引物,并人為引入PvuII酶切位點,以引物對newP為引物,PCR擴(kuò)增黃牛chemerin基因;
所述的引物對newP為:
上游引物:5’-CGGAGCCCACCAGACAGG-3’?????????18bp;
下游引物:5’-ctctgggctggcgctcaccgtgtcAgc-3’27bp;
用PvuII限制性內(nèi)切酶消化PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,再對酶切后的片段進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,根據(jù)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果同時鑒定黃牛的chemerin基因第868位和第1021位的堿基多態(tài)性。
2.如權(quán)利要求1所述的黃牛chemerin基因的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征在于,所述的PCR擴(kuò)增的反應(yīng)程序為:95℃預(yù)變性5min;35個循環(huán)的94℃變性30s,64℃退火30s,72℃延伸30s;72℃延伸10min。
3.如權(quán)利要求1所述的黃牛chemerin基因的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征在于,所述的瓊脂糖凝膠的質(zhì)量濃度為3.0%。
4.如權(quán)利要求1所述的黃牛chemerin基因的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征在于,用一種PvuII限制性內(nèi)切酶同時識別第868位和第1021位所在的PvuII酶切位點。
5.如權(quán)利要求1所述的黃牛chemerin基因的單核苷酸多態(tài)性的檢測方法,其特征在于,所述的根據(jù)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果及不同帶型的PCR產(chǎn)物測序結(jié)果,鑒定黃牛chemerin基因第868位和第1021位的堿基多態(tài)性存在三種單倍型:A(G-G),B(G-A)和C(A-G);這三種單倍型構(gòu)成六種基因型AA(G-G,G-G),BB(G-A,G-A),CC(A-G,A-G),AB(G-G,G-A),AC(G-G,A-G),和BC(G-A,A-G)。
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