[發明專利]檢測蛋雞FMO3基因多態性的試劑盒及其方法無效
| 申請號: | 201010255561.8 | 申請日: | 2010-08-17 |
| 公開(公告)號: | CN101899524A | 公開(公告)日: | 2010-12-01 |
| 發明(設計)人: | 潘玉春;陳強;王起山;張向喆;楊長鎖 | 申請(專利權)人: | 上海交通大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海交達專利事務所 31201 | 代理人: | 王錫麟;王桂忠 |
| 地址: | 200240 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 蛋雞 fmo3 基因 多態性 試劑盒 及其 方法 | ||
1.一種檢測蛋雞FMO3基因多態性的試劑盒,其特征在于,包括:堿基序列如下的正向引物和反向引物:正向引物:5’-CGGTGTTGAATGATGAC-3’反向引物:5’-GCATTTGTAGAGGGTAG-3’;dNTPs;DNA聚合酶及其相應10×PCR緩沖液;限制性核酸內切酶BsrI及其相應的10×酶切緩沖液;
所述的PCR緩沖液為:200mM?Tris-HCl;200mM?KCl;100mM(NH4)2SO4;15mM?MgCl2;
所述的酶切緩沖液為:100mM?Tris-HCl;100mM?MgCl2;1mg/ml?BSA。
2.一種如權利要求1所述的試劑盒檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)基因組DNA的提取采集雞翅膀根部靜脈血,利用DNA提取試劑盒提取基因組DNA,DNA樣品被稀釋成100ng/μl備用;
(2)利用步驟(1)中提取的基因組DNA為模板進行特異性PCR擴增;
(3)使用限制性內切酶對步驟(2)中的PCR產物進行酶切;
(4)將酶切產物進行瓊脂糖凝膠電泳,對基因型進行判定。
3.如權利要求2所述的檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征是,步驟(2)中PCR擴增反應體系為:雞基因組DNA?100ng、10×PCR緩沖液2.0μl、dNTPs(10mmol/L)混合物0.4μl、Taq?DNA聚合酶(2.5U/μl)0.4μl、正向引物6.0pmol、反向引物6.0pmol、用ddH2O補充混合液至20.0μl。
4.如權利要求3所述的檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征是,所述20.0μl?PCR擴增反應體系下,94℃預變性5min;后進入循環程序:94℃變性30s、56℃退火30s、72℃延伸45s,共計32個循環;72℃延伸10min。
5.如權利要求2所述的檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征是,所述步驟(2)中使用的特異性引物包括正向引物和反向引物,如下所示:
正向引物:5’-CGGTGTTGAATGATGAC-3’
反向引物:5’-GCATTTGTAGAGGGTAG-3’。
6.如權利要求2所述的檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征是,所述步驟(3)在10.0μlBsrI酶切體系中進行,10.0μlBsrI酶切體系包括:步驟(2)中PCR擴增產物8.5μl、10×酶切緩沖液1.0μl、內切酶BsrI(10U/μl)0.5μl。
7.如權利要求2所述的檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征是,步驟(3)中所述的限制性內切酶為BsrI內切酶。
8.如權利要求2所述的檢測蛋雞FMO3基因多態性的方法,其特征是,步驟(3)中所述的PCR產物包括自5’末端第1034位脫氧核糖核苷酸即T329S位點脫氧核糖核苷酸,根據該位點脫氧核糖核苷酸是野生型A還是突變型T對基因型進行判定:
如果酶切產物為146bp和78bp兩種片段,顯示檢測個體基因型為AA型,為野生型純合體,電泳結果為兩條帶;
如果酶切產物為224bp、146bp和78bp三種片段,顯示檢測個體基因型為AT型,為雜合體,電泳結果為三條帶;
如果酶切產物為224bp一種片段,顯示檢測個體基因型為TT型,為突變型純合體,電泳結果為一條帶。
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