[發明專利]結構型核酸指導的化學合成

有效

• 申請號: 201010254636.0
• 申請日: 2005-11-08
• 公開（公告）號: CN101914527A
• 公開（公告）日: 2010-12-15
• 發明（設計）人: N·J·V·漢森;P·布拉克斯克雅爾;M·H·漢森;L·K·彼特森;T·R·赫特尼爾
• 申請（專利權）人: 威泊根私人有限公司
• 主分類號: C12N15/10
• 分類號: C12N15/10;C40B30/00;C40B40/06
• 代理公司: 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038
• 代理人: 羅菊華

1.形成一種或多種化學結構的方法，其包括下列步驟：

(i)提供N＝3至100個載體模塊，其包括：

(1)第1個位置的載體模塊，具有

i)能夠與第N個位置的載體模塊的核酸區段雜交的核酸區段，和

ii)能夠與第2個位置的載體模塊的區段雜交的核酸區段，

(2)第n個位置的載體模塊，n＝2至N-1，具有能夠與第n-1個載體模塊的所述核酸區段雜交的核酸區段，和能夠與第n+1個載體模塊的區段雜交的核酸區段，和

(3)第N個位置的載體模塊，具有能夠與所述第N-1個載體模塊的所述核酸區段雜交的核酸區段，和能夠與所述第1個載體模塊的區段雜交的核酸區段，

其中

至少3個所述載體模塊包含位于在所述雜交區段之間的中間部分或其附近的締合的化學基團；

(ii)在允許所述雜交區段進行雜交的條件下使所述載體模塊接觸，從而使所述化學基團接近，其中所形成的化學化合物與至少一個所述載體模塊締合。

2.根據權利要求1的方法，其進一步包括下列步驟：提供允許第n-1個模塊與第n個模塊以及第N-1個模塊與第N個模塊的末端進行連接的條件，從而形成具有干-環結構和締合的化學化合物的鄰接的核酸分子。

3.權利要求1或2的方法，其中所形成的化學化合物與至少一個所述載體模塊或所述鄰接的核酸分子共價締合。

4.根據權利要求3的方法，其包括

在允許雜交區段進行雜交的條件下使載體模塊接觸，從而使化學基團達到反應接近度；和

提供允許化學基團進行反應的條件，其中所形成的化學化合物與至少一個載體模塊締合；和允許第n-1個模塊與第n個模塊以及第N-1個模塊與第N個模塊的末端進行連接的條件，從而形成具有干-環結構和締合的化學化合物的鄰接的核酸分子。

5.根據權利要求1的方法，其中所述載體模塊的接觸順次或同時進行。

6.根據權利要求4的方法，其中化學基團的反應順次或同時進行，和/或其中所述連接以酶促或化學的方式并且順次或同時進行。

7.根據權利要求6的方法，其進一步包括至少在所述第1個載體模塊中和/或至少在所述第N個載體模塊中的用于DNA聚合酶、RNA聚合酶或逆轉錄酶位點的引發位點。

8.根據權利要求7的方法，其包括實施酶促延伸反應以展示所形成的化學化合物的進一步步驟。

9.根據權利要求8的方法，其中N為3、4、5、6或7，并且特別地其中每個所述載體模塊包含位于在所述雜交區段之間的中間部分或其附近的締合的化學基團，和位于所述雜交區段之一的外部的密碼子區段。

10.根據權利要求9的方法，其中通過具有在一個或多個位置上的載體模塊的集合而合成超過一種化合物的文庫。

11.根據權利要求10的方法，其中所述在至少一個位置上的集合包括至少10個不同的載體模塊。

12.根據權利要求11的方法，其中所述在至少兩個位置上的集合包括至少10個不同的載體模塊。

13.根據權利要求3的方法，其中所述中間部分包括化學鍵或1-20個核苷酸。

14.根據權利要求13的方法，其中所述化學基團與所述中間部分的核堿基締合。

15.根據權利要求13的方法，其中所述化學基團與所述中間部分的磷酸二酯鍵締合。

16.根據權利要求15的方法，其中所述化學基團通過一個或多個共價鍵與所述中間部分締合。

17.用于篩選超過一種化學化合物的文庫的方法，所述化學化合物通過根據權利要求8的方法來制備，所述方法包括下列步驟：

在所述文庫中探查有著具有所需特性的化學化合物的文庫成員；

將具有所需特性的文庫成員與不具有所需特性的文庫成員分開；和

從而獲得具有所需特性的文庫成員的富集匯集物。

18.根據權利要求17的方法，其中所述方法進一步包括擴增所述富集匯集物的成員的核酸，所述核酸表明所述化學反應的歷史。

19.組合物，其包含核酸和締合的化學化合物的結構或超過一種此類結構的文庫，所述結構能通過權利要求1-16中任一項的方法獲得。