[發(fā)明專利]一種同步檢測多種煙草病毒的方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010232750.3 | 申請日: | 2010-07-21 |
| 公開(公告)號: | CN101875982A | 公開(公告)日: | 2010-11-03 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 成巨龍;吳云鋒 | 申請(專利權(quán))人: | 陜西省煙草研究所;西北農(nóng)林科技大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京億騰知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所 11309 | 代理人: | 陳惠蓮 |
| 地址: | 710061 陜*** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 同步 檢測 多種 煙草 病毒 方法 | ||
1.一種同步檢測2-5種煙草病毒的方法,該方法包括煙草病毒總RNA的提取,多重RT-PCR和電泳檢測確定病毒種類,其中煙草病毒選自煙草花葉病毒(TMV)、黃瓜花葉病毒(CMV)、馬鈴薯Y病毒(PVY)、煙草蝕紋病毒(TEV)和煙草脈帶花葉病毒(TVBMV)中的2-5種,其中多重RT-PCR反應(yīng)中應(yīng)用的引物為包含如下5對引物中的2-5對引物的引物組:
第1對引物:
SEQ?ID?NO.1:5′-TAGACCCGCTAGTCACAG-3′
SEQ?ID?NO.2:5′-CAGAGGTCCAAACCAAAC-3′
第2對引物:
SEQ?ID?NO.3:5′-GTGGGTGACAGTTCGTAAA-3′
SEQ?ID?NO.4:5′-GTGGGAATGCGTTGGT-3′
第3對引物:
SEQ?ID?NO.5:5′-TGATGGATGGTGAGGAG-3′
SEQ?ID?NO.6:5′-GTGCCGTTCAGTGTCTT-3′
第4對引物:
SEQ?ID?NO.7:5′-CCGAGAATCAAGGCTATC-3′
SEQ?ID?NO.8:5′-CGCTAAACCTACATCCC-3′
第5對引物:
SEQ?ID?NO.9:5′-GAGGTCGTGAACTTACAGC-3′
SEQ?ID?NO.10:5′-GAGGTCGTGAACTTACAGC-3′。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中引物組中包含5對引物SEQ?IDNO.1-10。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,該方法包括如下步驟:
1)病毒總RNA的提取:
提取感染2-5種病毒的煙草葉中的病毒總RNA;
2)多重RT-PCR:
應(yīng)用SEQ?ID?NO.2、4、6、8、10(第1-5對引物中反向引物序列)對病毒總RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄制備cDNA模板,然后應(yīng)用SEQ?ID?NO.1-10(第1-5對引物中的正向和反向序列)對cDNA模板進(jìn)行多重PCR反應(yīng),得擴增產(chǎn)物;
3)電泳檢測:
對擴增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,獲得病毒基因擴增產(chǎn)物條帶,判定煙草病毒種類。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其中多重PCR反應(yīng)中五對引物濃度比例為第1對引物∶第2對引物∶第3對引物∶第4對引物∶第5對引物=1.2-1.6∶0.8-1.2∶0.8-1.2∶0.8-1.2∶1.3-1.7。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其中多重PCR反應(yīng)中五對引物濃度比例為第1對引物∶第2對引物∶第3對引物∶第4對引物∶第5對引物=1.4∶1∶1∶1∶1.5。
6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其中多重PCR反應(yīng)中dNTPs濃度為0.12-0.32mmol/L;Taq?DNA聚合酶濃度為0.02-0.12U/μL;Mg2+濃度為1.2-3.2mmol/L。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其中多重PCR反應(yīng)中dNTPs濃度為0.28mmol/L,Taq?DNA聚合酶濃度為0.10U/μL,MG2+濃度為2.4mmol/L。
8.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其中多重PCR反應(yīng)中,退火溫度為48-51℃,延伸時間為60s-90s,循環(huán)次數(shù)為3045次。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其中多重PCR反應(yīng)中,擴增條件為退火溫度51℃,延伸時間60s,循環(huán)次數(shù)35次。
10.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其中病毒總RNA的提取過程中,采用BIOzol試劑盒提取總RNA。
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