[發(fā)明專利]一種糖苷內切酶催化同位素標記N-糖鏈的方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010222361.2 | 申請日: | 2010-07-09 |
| 公開(公告)號: | CN101906452A | 公開(公告)日: | 2010-12-08 |
| 發(fā)明(設計)人: | 張偉;汪泓;楊芃原 | 申請(專利權)人: | 復旦大學 |
| 主分類號: | C12P21/00 | 分類號: | C12P21/00 |
| 代理公司: | 上海正旦專利代理有限公司 31200 | 代理人: | 陸飛;盛志范 |
| 地址: | 200433 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 糖苷 內切酶 催化 同位素標記 方法 | ||
技術領域
本發(fā)明屬分析化學技術領域,具體涉及一種同位素標記N-糖鏈的方法,尤其涉及一種糖苷內切酶催化的同位素18O標記N-糖鏈的方法。
背景技術
蛋白質糖基化是生物體內最普遍、最重要、也是最復雜的蛋白質翻譯后修飾(PTMs)之一。蛋白質糖基化修飾始于內質網和高爾基體,成熟后或定位于質膜、胞質中發(fā)揮功能;或分泌到細胞外,形成分泌蛋白。糖鏈在生物功能方面發(fā)揮著重要作用,糖鏈會影響蛋白的結構、定位和功能,影響分子和細胞的識別、信號傳導和相互作用等等。此外,許多疾病也與糖基化的異常有著密切關系,在臨床研究上,糖蛋白與糖鏈是潛在的疾病分子標志物和藥物靶標。
因此,研究不同生理或疾病狀態(tài)下糖鏈相對量的變化具有重要意義,定量糖組學也應運而生。定量糖組學的分析方法主要是利用同位素標記技術,即將同位素標記的糖鏈與不標記的糖鏈等量混合,并由質譜檢測。在質譜中,同位素標記的糖鏈與不標記的糖鏈離子化效率相當,并形成有一定道爾頓差異的兩個獨立峰,根據峰強或峰面積比即可實現糖鏈的相對定量。目前,糖鏈的同位素標記方法主要有三種:基于同位素碘甲烷的全甲基化同位素標記,基于同位素苯胺的糖鏈還原末端同位素標記,和基于代謝方法的同位素標記。但是,這些方法都存在一定的弊端,前兩種方法涉及化學反應,需要額外的反應試劑和步驟,這不僅影響標記效率,而且會產生副反應,對后續(xù)分析十分不利;而后一種方法不僅操作復雜,而且只能用于細胞樣品,應用范圍有限。
本發(fā)明提出的酶催化同位素標記糖鏈的方法,采用了生物酶催化反應,避免了化學反應對樣品產生的不利影響;且同位素18O不影響糖鏈的質譜離子化效率,18O標記的糖鏈與不標記的糖鏈離子化效率完全相同,可以高效地用于糖鏈相對定量。本發(fā)明提出的酶催化同位素標記糖鏈的方法,彌補了糖鏈同位素18O標記技術的空白,在糖組學、糖生物學、生物醫(yī)學等領域有著良好的應用前景。
發(fā)明內容
本發(fā)明的目的在于提出一種簡單、高效、無副反應的酶催化同位素標記糖鏈的方法。
本發(fā)明提出的酶催化同位素標記糖鏈的方法,即糖苷內切酶催化同位素標記N-糖鏈的方法,是在糖苷內切酶的作用下,在N-糖鏈的還原末端標記上一個同位素18O分子,它包括以下步驟:將糖蛋白樣品和糖苷內切酶溶于18O水(H218O)配置的緩沖溶液中,糖蛋白在緩沖溶液中的濃度為0.1-10微克/微升;將溶液放置于37℃進行酶解,酶解時間12-20小時;將溶液用超濾管進行超濾,去除酶解后的蛋白和糖苷內切酶;將緩沖溶液用石墨化碳柱進行處理,去除緩沖溶液中的鹽;將溶液冷凍干燥,并質譜檢測標記,標記的糖鏈在質譜中表現為比不標記的糖鏈分子量高2道爾頓的獨立峰。
糖苷內切酶主要包括以下幾種亞型:Endo?H、Endo?F1、Endo?F2或Endo?F3,或者廣義上的糖苷內切酶PNGase?F、PNGase?A。所有糖苷內切酶亞型均適用于本發(fā)明,僅緩沖溶液需做相應改變。
本發(fā)明的積極效果如下:
1、簡單、高效,不需要額外的試劑和步驟,不產生副反應,避免了化學反應的不利因素;
2、只要酶解反應發(fā)生,標記反應就發(fā)生,標記效率高;
3、標記的糖鏈,其物理、化學性質穩(wěn)定;
4、標記無樣品類型限制,應用范圍廣;
5、同位素18O不影響糖鏈的質譜離子化效率,標記與不標記的糖鏈離子化效率完全相同。
附圖說明
圖1為MALDI質譜檢測糖苷內切酶Endo?H催化的同位素18O標記和不標記的糖鏈的質譜譜圖。上圖是不標記的糖鏈譜圖,下圖是同位素18O標記的糖鏈譜圖。譜圖清晰地顯示了同位素18O標記和不標記的糖鏈峰之間2道爾頓分子量的差異。該圖所用的糖蛋白樣品為蔗糖酶(Invertase)。G及其數字表示糖鏈中乙酰葡糖胺的數量;M及其數字表示糖鏈中甘露糖的數量。所有離子均為單電荷的鈉離子加合物。
圖2為圖1中G1M10糖鏈峰的放大圖。上圖為不標記的G1M10譜圖,下圖為同位素18O標記的G1M10譜圖。
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