[發明專利]全細胞蛋白和基因相互作用網絡分析系統無效
| 申請號： | 201010202475.0 | 申請日： | 2010-06-17 |
| 公開（公告）號： | CN102289432A | 公開（公告）日： | 2011-12-21 |
| 發明（設計）人： | 蘇峰;李奇;李睿 | 申請（專利權）人： | 上海其明信息技術有限公司 |
| 主分類號： | G06F17/30 | 分類號： | G06F17/30 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 201210 上海*** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 細胞 蛋白 基因 相互作用 網絡分析 系統 | ||
【權利要求書】：
1.一種全細胞蛋白和基因相互作用網絡，解析KEGG數據庫，其特征在于將KEGG數據庫的多種功能間相互做關系連通，并連接了所有常用蛋白相互作用數據庫，共同構筑了全細胞網絡分析系統。
2.根據權利要求1所述的對于KEGG的整合，其特征在于利用xpath技術對xml文件進行解析，解析結果保存和導入數據庫。導入數據庫的過程為：通過預定義的Sq1模板：創立數據庫連接，創建數據表(若數據表不存在，存在則清空數據)，導入數據，提交并關閉數據庫連接。
3.根據權利要求1所述的構建方法為：(1)在數據庫中搜索滿足篩選條件的基因的上游和下游基因，而該上游和下游基因須同時滿足篩選條件；(2)根據基因與其上下游相互作用關系畫出基因間連接線，基因用圓圈來表示，相互作用用線段表示，其標識為[1]。
4.根據權利要求1所述的對其他蛋白質相互作用數據庫的整合，除了運用了kegg數據庫，又新添加了數據庫。
5.根據權利要求1所述的網絡結構分析，為了發現網絡中的核心調控基因，使用網絡拓撲技術分析網絡核心調控基因。
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