[發明專利]HIV-1 O組(或亞組)逆轉錄病毒抗原的核苷酸序列無效
| 申請號: | 201010200895.5 | 申請日: | 1995-10-20 |
| 公開(公告)號: | CN102134609A | 公開(公告)日: | 2011-07-27 |
| 發明(設計)人: | P·查尼恩;F·克拉維爾;A·伯爾曼;C·奎蘭特;D·古塔爾德;L·蒙塔格尼爾;J·當約恩迪薩恩特馬丁;J·H·M·庫翰 | 申請(專利權)人: | 巴斯德研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12P21/00 |
| 代理公司: | 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038 | 代理人: | 羅菊華 |
| 地址: | 法國*** | 國省代碼: | 法國;FR |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | hiv 逆轉錄 病毒 抗原 核苷酸 序列 | ||
1.體外檢測生物樣品中HIV-1?O組病毒的感染方法,所述方法包括:
i)使所述樣品在一定條件下與至少一種探針接觸,其中所述探針衍生自或由HIV-1(VAU)或HIV-1(DUR)的env、gag或pol基因的至少100bp的片段組成,所述條件能夠導致與O組HIV病毒的強雜交以及與M組HIV病毒的弱雜交,和
ii)檢測所述探針和包含在所述生物樣品中的核酸之間的分子雜交。
2.根據權利要求1的方法,其進一步包括,在所述檢測之前,將探針/核酸復合物固定在適宜的固體支持物上以及用合適的洗滌溶液洗滌所述固體支持物。
3.根據權利要求1-2中任一項的方法,其中衍生自HIV-1(VAU)或HIV-1(DUR)的env、gag或pol基因的探針選自:
i)含有SEQ?ID?NO:5的序列;
ii)在高嚴緊條件下與SEQ?ID?NO:5特異性雜交的核酸;
iii)含有SEQ?ID?NO:7的序列;
iv)在高嚴緊條件下與SEQ?ID?NO:7特異性雜交的核酸;
v)513bp的gag基因的擴增序列,如SEQ?ID?NO:9所示;
vi)525bp的V3環序列,如SEQ?ID?NO:10所示;
vii)312bp的優勢免疫區序列,如SEQ?ID?NO:11所示;
viii)通過引物4506(SEQ?ID?NO:1)和引物5011(SEQ?ID?NO:2)擴增的pol擴增子;
ix)通過引物TH2(SEQ?ID?NO:3)和引物UH2(SEQ?ID?NO:4)擴增的env基因擴增子;
x)編碼SEQ?ID?NO:5的1至526位氨基酸且定義在SEQ?ID?NO:6中的核酸;
xi)編碼SEQ?ID?NO:5的527至877位氨基酸且定義在SEQ?ID?NO:8中的核酸;
xii)擴增自HIV-1(DUR)的gag擴增子,所述擴增子編碼含有下列區域的肽:
a)SPRTLNAWVKAVEEKAFNPEIIPMFMALSEGA,
b)MLNAIGGHQGALQVLKEVIN,
c)GPLPPGQIREPTGSDIAGTTSTQQEQI,和
d)VGDIYRKWIVLGLNKMVKMYSPV。
4.根據權利要求1-3中任一項所述的方法,其中探針使經標記的。
5.根據權利要求4的方法,其中所述標記選自放射性標記、酶標記或熒光標記。
6.根據權利要求1-5中任一項所述的方法,其中所述的生物樣品選自血液、血漿、血清、組織、細胞培養物或細胞提取物。
7.擴增自HIV-1(DUR)的gag擴增子,所述擴增子編碼含有下列區域的肽:
i)SPRTLNAWVKAVEEKAFNPEIIPMFMALSEGA,
ii)MLNAIGGHQGALQVLKEVIN,
iii)GPLPPGQIREPTGSDIAGTTSTQQEQI,和
iv)VGDIYRKWIVLGLNKMVKMYSPV。
8.產生肽或多肽的方法,其包括表達選自如下的分離的核酸:
i)含有SEQ?ID?NO:5的序列;
ii)在高嚴緊條件下與SEQ?ID?NO:5特異性雜交的核酸;
iii)含有SEQ?ID?NO:7的序列;
iv)在高嚴緊條件下與SEQ?ID?NO:7特異性雜交的核酸;
v)513bp的gag基因的擴增序列,如SEQ?ID?NO:9所示;
vi)525bp的V3環序列,如SEQ?ID?NO:10所示;
vii)312bp的優勢免疫區序列,如SEQ?ID?NO:11所示;
viii)通過引物4506(SEQ?ID?NO:1)和引物5011(SEQ?ID?NO:2)擴增的pol擴增子;
ix)通過引物TH2(SEQ?ID?NO:3)和引物UH2(SEQ?ID?NO:4)擴增的env基因擴增子;
x)編碼SEQ?ID?NO:5的1至526位氨基酸且定義在SEQ?ID?NO:6中的核酸;
xi)編碼SEQ?ID?NO:5的527至877位氨基酸且定義在SEQ?ID?NO:8中的核酸;
xii)擴增自HIV-1(DUR)的gag擴增子,所述擴增子編碼含有下列區域的肽:
a)SPRTLNAWVKAVEEKAFNPEIIPMFMALSEGA,
b)MLNAIGGHQGALQVLKEVIN,
c)GPLPPGQIREPTGSDIAGTTSTQQEQI,和
d)VGDIYRKWIVLGLNKMVKMYSPV;和
Xiii)在i)至xii)中定義的探針之一的至少100bp片段。
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