[發明專利]檢測核酸微陣列的異常樣點的方法

無效

• 申請號: 201010193364.8
• 申請日: 2010-05-27
• 公開（公告）號: CN101899507A
• 公開（公告）日: 2010-12-01
• 發明（設計）人: 吉田淳哉;金原秀行;氏原大;稻澤讓治;井本逸勢
• 申請（專利權）人: 富士膠片株式會社;國立大學法人東京醫科齒科大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 中科專利商標代理有限責任公司 11021
• 代理人: 陳平

1.一種使用核酸微陣列檢查具有靶序列(a)的靶核酸量的核酸分析方法，其中

所述核酸微陣列具有多個樣點，探針核酸固定在所述樣點上，以及

在所述多個樣點的任選樣點(X1m)上，固定了包括與所述靶序列(a)互補的探針序列(a’)和與所述探針序列(a’)不同的序列(b’)的探針核酸，其中m表示給定的整數，

所述方法包括：

通過將包含能夠與所述序列(b’)結合的序列(b)的標記的異常檢測核酸(B)加至所述核酸微陣列上的樣點(X1m)，將所述序列(b’)與序列(b)雜交；

獲得所述樣點(X1m)中經雜交的異常檢測核酸(B)的標記量值(Fc1m)；

并且基于所述測量的標記量值(Fc1m)確定所述樣點(X1m)是否為具有異常雜交能力的異常樣點。

2.根據權利要求1所述的方法，所述方法進一步包括：

通過將標記的靶核酸(A)加至樣點(X1m)上，將所述探針序列(a’)與所述靶序列(a)雜交；以及

獲得在樣點(X1m)中被雜交的標記的靶核酸(A)的標記量值(F1m)。

3.根據權利要求1所述的方法，其中

所述序列(b’)與所述序列(b)的雜交和將所述探針序列(a’)與所述靶序列(a)雜交同時進行，并且

所述異常檢測核酸(B)的標記量值(Fc1m)的獲得和所述靶核酸(A)的標記量值(F1m)的獲得同時進行。

4.根據權利要求1所述的方法，所述方法進一步包括：

從樣點(X2m)獲得所述異常檢測核酸(B)的標記量值(Fc2m)，所述樣點(X2m)存在于與所述樣點(X1m)相同的陣列上或存在于與其不同的陣列上，并且所述樣點(X2m)包括與所述樣點(X1m)相同類型的探針核酸，其中

基于所述標記量值(Fc1m)和所述標記量值(Fc2m)的比較結果來確定所述樣點(X1m)是否為異常樣點。

5.根據權利要求4所述的方法，其中

包括具有相同類型的探針核酸的兩個樣點(X1i)和(X2i)的樣點對中的n對存在于所述相同的核酸陣列或不同的核酸微陣列上，其中n表示2以上的整數，i表示整數，1≤i≤n，且1≤m≤n，以及

確定所述樣點(X1m)是否為異常樣點包括：

計算包括所述樣點(X1i)和所述樣點(X2i)的樣點對的標記量值(Fc1i)和標記量值(Fc2i)之間的各個比較值(D_Bi)，

基于所述n個比較值(D_B1)到(D_Bn)獲得代表值(A)，并

基于所述比較值(D_Bm)和代表值(A)之間的差值大小來確定所述樣點(X1m)是否為異常樣點。

6.根據權利要求5所述的方法，其中

各個比較值(D_Bi)通過下面的公式(1)來計算，

比較值(D_Bi)

＝Log₂{(標記量值(Fc1i))/(標記量值(Fc2i))}

????????????????????????????????????????????????(1)

所述代表值(A)是n個比較值(D_B1)到(D_Bn)的平均值或中值，并且

當所述比較值(D_Bm)和所述代表值(A)之間的差值大于所述n個比較值(D_B1)到(D_Bn)的標準偏差值時，確定包括所述樣點(X1m)和(X2m)的所述樣點對是異常樣點對。